SplazerS-我期望中SV分析的补充方法

热度 1 黎瑞源 2012-1-17 10:28

今天阅读文献的时候发现了用于SV检测的新软件-SplazerS，一中splicing alignment based的SV检测方法，这种方法通过把高通量测序序列与参考序列做splicing mapping，发现插入/缺失的断点位置，达到发现SV的目的。之前，很多sV分析软件主要同计算双定位到参考序列上的末端序列的定位位置之间的距离与建库的插入长度的差异来分 ...

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新的软件售卖模式：云端软件免费使用，云服务商给软件开发者付费

黎瑞源 2011-11-19 17:07

今天又看到了基于amazon开发的生物信息软件（ http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/early/2011/11/13/bioinformatics.btr630.abstract?etoc ），联想到之前看到的一个新闻 :Eagle Genomics to Offer John Innes Centre's SNP-Analysis Software via Service Model .感到新的软件售卖模式就业来临了。这就 ...

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我为博士课程考试学的新一代测序技术总结！

热度 5 黎瑞源 2011-4-12 17:25

我为博士课程考试准备的新一代测序技术总结 （新一代测序技术的序列分析方法及在油菜基因组研究中的应用.docx ）！很多地方可能不对或考虑不周到，欢迎大家提出批评意见。

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我想象中的理想统计分析工具

热度 3 黎瑞源 2011-3-17 10:47

从大学3年级做毕业课题开始，一直到现在，本人了大概有10年的数据分析经历了。在数据分析中的过程中，总是备受煎熬，在选择哪个分析工具的时候，总是觉得有不完善的地方，于是在不停的纠结中。也在不停的思考中，总是梦想着能有一个能满足我所有要求的分析软件。我想象中的理想分析软件应该： （1）有丰富的统计分析功能， ...

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在新的位置使用firefox for zotero

黎瑞源 2010-10-5 15:53

firefox是一款非常优秀的浏览器，基于插件式的方法，其提供了成千上万的可用插件和扩展，其中，我很喜欢使用的一个是zotero( http://www.zotero.org/ ), 使用zotero需要在Firefox应用程序profile目录下新建一个zotero的文件夹，这个文件夹默认在C盘，然后把所有相关的文件都保存到里面（比如PDF文件，数据库文件等），所以 ...

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