生物信息学中多重检验问题的一个例子（FDR、p值、q值）

宋景和 2016-4-5 17:57

这是看《How does multiple testing correction work》一文的笔记和总结。 多重检验问题是搞生物信息学时几乎绕不开的问题，笔者不是生物信息学出身（学计算机的），被FDR，p-value，q-value搞得晕头转向，听人家说这篇文章讲的比较清楚，所以耐着性子看了一遍来给大家汇报。但是注意这只是一个比较直观的解释，如果想 ...

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凝聚法层次聚类之ward linkage method

热度 1 宋景和 2015-9-18 22:22

凝聚法分层聚类中有一堆方法可以用来算两点（pair）之间的距离：欧式，欧式平方，manhattan等，还有一堆方法可以算类（cluster）与类之间的距离，什么single-linkage、complete-linkage、还有这个ward linkage。（即最短最长平均，离差平方和） 其他的好像都挺好理解，就是最后这个有点麻烦。。。 这个方法说白了 ...

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