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GitHub双重身份验证(two-factor authentication, 2FA)解决方案
黄健 2024-1-27 12:54
双十二的时候,收到 GitHub 官方的通知邮件,要求我启用 双重身份验证( two-factor authentication, 2FA ) 用户。邮件主要内容如下: We're reaching out to let you know that, as announced last year, we have officially begun requiring users who contribute code on GitHub.com to have two-factor auth ...
个人分类: 科学研究|1444 次阅读|1 个评论
噬菌体展示技术诞生的启示:循序渐进,水到渠成
热度 1 黄健 2024-1-10 09:03
噬菌体展示 (Phage Display) 技术之父 乔治 · 史密斯 (George P Smith) 教授第一次接触噬菌体是在哈弗福德学院( Haverford College )读大学期间。他想挑战抗体产生的模板学说,证明抗体的抗原特异性决定于编码抗体的 mRNA 。于是他用噬菌体 T4 免疫兔子,然后从兔子脾脏提取 RNA ,加入无细胞 ...
个人分类: 科学研究|7087 次阅读|2 个评论 热度 1
PGPLOT窗口美化
黄健 2023-9-22 11:14
对目前默认的PGPLOT窗口不太满意 ,耿耿于怀。最近看了 这样一个网页 ,有一些相关介绍。于是参考着在自己的主目录内新建了一个.Xresources文件,内容如下: # Created by Jian Huang to customize PGPLOT windows # To hide the PGPLOT server window set pgxwin.server.visible: False # To provide a way to destr ...
个人分类: 人才培养|1199 次阅读|没有评论
AlphaMissense不完全测评报告
黄健 2023-9-22 09:22
这两天我的微信群与朋友圈颇有被Google DeepMind团队刚刚在 Science杂志上发表的AlphaMissense 刷屏的趋势,说能精准预测蛋白质错义突变的表型。根据介绍,这个 AlphaMissense既对AlphaFold进行了微调,考虑了蛋白质结构的影响,又整合了一种受 ChatGPT 等大型语言模型启发的神经网络,有蛋白质语言模型的加持。AlphaFo ...
个人分类: 科学研究|1830 次阅读|没有评论
比较giza-dev与pgplot5
黄健 2023-8-31 17:05
虽然解决了 PDL::Graphics::PGPLOT不能完全正常工作的问题 ,但对giza还是有点留恋的。因为giza只显示画图的窗口,且窗体默认背景是我比较喜欢的白色,而且其中产生的图与图中标记的文字也更漂亮。当然,我不大喜欢giza窗口默认的标题giza,也很无奈放大窗口图就消失。此外, giza窗口无 法通过点击窗口的x钮关闭,但通 ...
个人分类: 人才培养|1070 次阅读|没有评论
解决PDL::Graphics::PGPLOT不能正常工作的问题
黄健 2023-8-31 15:28
如前所述 ,最近在把两个版本的PDL Book(2012年2月版、2015年5月版)的电子书(.pdf格式)转化为可在IPerl内核的Jupyter Notebook中进行交互学习的电子书(.ipynb格式)。在制作基于2012年2月版第二章内容的.ipynb文件时,示例中的use PDL::Graphics::TriD代码居然不工作, 最终自己想办法找到问题解决了 。 ...
个人分类: 人才培养|1218 次阅读|没有评论
解决PDL::Graphics::TriD不工作的问题
黄健 2023-8-18 16:32
最近在把两个版本的PDL Book(2012年2月版、2015年5月版)的电子书(.pdf格式)转化为可在IPerl内核的Jupyter Notebook中进行交互学习的电子书(.ipynb格式)。在制作基于2012年2月版第二章内容的.ipynb文件时,示例中的use PDL::Graphics::TriD代码居然不工作,并反馈错误信息: Can't load '/usr/ ...
个人分类: 人才培养|1041 次阅读|1 个评论
升级到Ubuntu23.04
黄健 2023-7-6 19:07
系统给我推送了好多次,可以升级到23.04版了,可之前 升级导致的种种问题 经历 让 我不敢造次。前段时间 折腾MXNet与AI-MXNet中出了各种状况 ,刚刚我已说过一些。其实还有很多没说,比如我尝试过各个版本的MXNet;对于AI-MXNet,除了手动源代码编译安装外,也尝试过sudo cpan,或用户cpanm安装。 值得特别一书的是 ...
个人分类: 人才培养|1513 次阅读|没有评论
在Ubuntu上从源代码安装MXNet及Perl编程接口
黄健 2023-7-6 15:00
近年来,深度学习非常火,也发展出TensorFlow、Keras、Caffe、PyTorch、Theano、CNTK、 MXNet 、PaddlePaddle、Deeplearning4j、ONNX等一系列开源的深度学习框架。在深度学习相关应用开发中,使用最为广泛的无疑是Python编程语言。就我所知,目前,只有MXNet提供了Perl编程语言的API。六年前,我 在基于Gentoo Linux的服 ...
个人分类: 人才培养|1510 次阅读|没有评论

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