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- [转载]单细胞数据库大全第二弹 —— 疾病数据库
- 随着单细胞测序技术在疾病研究领域的深度渗透，从神经退行性疾病到自身免疫病，从代谢综合征到罕见病，海量疾病相关的单细胞数据正以前所未有的速度积累。这些数据不仅承载着疾病发生发展的分子机制密码，更成为推动临床转化研究的核心动力。然而，在具体研究实践中，新的挑战也随之浮现： ...
- [转载]项目文章：ac4C修饰驱动骨质流失？干湿结合多组学揭示破骨细胞新机制
- 随着表观遗传调控研究不断深入，人们对RNA层面的转录后修饰逐渐重视起来。尤其是在N6-甲基腺苷（m6A）、N4-乙酰胞苷（ac4C）等修饰类型被相继发现后，越来越多证据显示，它们在调控基因表达、细胞分化和疾病发生中可能发挥关键作用。 然而，RNA修饰在骨代谢相关疾病，尤其是绝经后骨质疏松（PMOP）中的 ...
- [转载]SpatialQC：空间转录组质控报告自动化工具解析
- 在当今的生命科学研究中，空间转录组学作为一种前沿技术，能够在空间维度上揭示基因表达的复杂图谱，已经成为揭示生物体内细胞异质性的重要手段。随着空间转录组技术的飞速发展，我们能够在亚细胞分辨率和大视野下研究基因的空间表达分布。然而，尽管新技术为科研带来了巨大的潜力，但同时也伴随着重大挑战，尤其 ...
- [转载]单细胞数据库汇总第一期—聚焦癌症研究的宝藏资源
- 在生命科学研究中，解析基因差异表达、获取癌症相关数据支持实验，常依赖于经典的高通量测序和 TCGA 等数据库。而单细胞测序技术的发展，催生了海量精细数据，也引发出新的研究思路和迫切需求： 首先，面对丰富的公共单细胞资源，能否便捷、快速地查询目标 ...
- [转载]单细胞助测序辅助共病研究：揭示肾脏-口腔疾病关联新机制
- 慢性肾脏病（CKD）是全球高发的慢性疾病，以肾功能渐进性减退为特征，不仅影响泌尿系统，更会引发全身免疫紊乱与代谢异常，显著增加多种并发症风险 。而口腔鳞状细胞癌（OSCC）作为口腔癌中最常见的类型，占比超 90%，其进展迅速且易发生淋巴结转移，5 年生存率不足 50%，严重威胁患者生命健康 。 近年来，临床中逐渐 ...
- [转载]单细胞分析--如何完善降维可视化效果
- 最近，总有小伙伴和我说： “ 我跟着 Seurat 的官网跟了一遍教程，但是处理自己的数据的时候，效果总是不让人满意，有没有什么办法？ ” 今天就来试试用调整参数的方式来看看能不能让 Seurat 的 UMAP 可视化变得好一些。 在开始之前，先一起回顾一下用 Seurat 进行单细胞分析流程吧 ~ Seurat 分析流程 ...
- [转载]单细胞分析——借助CNV定位癌细胞
- 在单细胞研究中，如何准确地将癌细胞从复杂的细胞群体中注释出来，是一个重大挑战。批量测序（Bulk RNA-seq）在面对高度异质性的肿瘤样本时，对此无能为力。解决问题的关键，往往在于癌细胞独特的基因组特征——拷贝数变异（CNV）。因此，单细胞CNV分析成为了鉴定癌细胞的一种决定性手段。它通过揭示单个细胞水平上大规模 ...
- [转载]【客户文章】机器学习+单细胞测序揭示圆锥角膜治疗新靶点
- 英文标题： Deciphering mitochondrial dysfunction in keratoconus: Insights into ACSL4 from machine learning-based bulk and single-cell transcriptome analyses and experimental validation 中文标题： 解析圆锥角膜中线粒体功能障碍：基于机器学习的批量和单细胞转录组分析及实验验证对 ACSL4 的新 ...
- [转载]【项目文章】多组学短快平发文——测序技术助力发现角膜瘢痕重要因子
- 英文标题： Integrated transcriptome and proteome analysis identifies keratins as key regulators of corneal scarring in a murine model 中文标题： 整合转录组和蛋白质组分析鉴定角蛋白为小鼠模型角膜瘢痕形成的关键调节因子 发表期刊： Computational and Structural Biotechnology Journal ...
- [转载]项目文章：从ac4C修饰到胃癌致病机制，NAT10的潜力与突破
- 胃癌一直是全球范围内致死率极高的恶性肿瘤之一，尽管近年来治疗手段不断进步，但对于中晚期胃癌患者来说，整体预后仍不理想。在上篇推文中，我们聊到 ac4C 修饰在绝经后骨质疏松（ PMOP ）中的研究进展。今天，我们一起来看一看 ac4C 在癌症领域，尤其是胃癌中的研究是怎样展开的。 近日，福建医 ...
