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SleepyFlyR:一种用于果蝇睡眠和活动分析的R包
摘要:黑腹果蝇被广泛用于睡眠和节律的研究。在众多研究果蝇睡眠行为的工具中,果蝇活动监测(DAM)系统凭借其简单且高效的特点被全世界的研究人员所认可。基于DAM系统生成的简单数据,研究人员可以从中分析出大量描述睡眠和节律的参数。但是,现有的DAM数据分析软件只覆盖了部分参数,而且无法提供详细的个体数据以便用户使用其他绘图软件进行分析。因此我们开发了SleepyFlyR,其特点包括:(1)简单易用并且附带UI文本,方便用户进行操作;(2)提供全面的果蝇睡眠与活动分析,涵盖多种参数;(3)生成睡眠和活动的活动度图;(4)绘制多天平均或者单天的睡眠与活动曲线;(5)给定实验组天数与对照组天数,计算睡眠与活动参数的变化量;(6)分析结果同时包括总结数据和详细的个体数据,且结果文件会根据用户的设置自适应命名。
关键词:黑腹果蝇,睡眠,R包,果蝇活动监测系统,行为学分析
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Mou, Y., Ping, Y. SleepyFlyR: An R Package for Sleep and Activity Analysis in Drosophila. J. Shanghai Jiaotong Univ. (Sci.) 30, 744–750 (2025). https://doi.org/10.1007/s12204-024-2706-3
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