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什么可以作为“新代谢物”?
它可以是化学结构从未被发现的新分子,也可以是已知分子家族中尚未被认识的衍生物,还可以是一种早已存在于数据库中、却从未被发现参与某一生理过程的代谢物。对于生命科学研究而言,后者未必不“新”:一个熟悉的分子,如果被发现承担了此前未知的生物学功能,同样可能带来重要突破。
传统的代谢物发现通常从非靶向代谢组学开始,检测成千上万个信号峰,寻找组间差异最大的分子,再将其与差异菌群、宿主表型和代谢通路进行关联。这套方法推动了大量研究,大量文章发表,却也形成了一种惯性——差异倍数越大、统计学越显著,就越容易被选为“关键代谢物”。
然而,差异最大并不等于生物学意义最大。
肠道中的一种代谢物即使变化十倍,如果不能被吸收,不能进入循环,也不能作用于远端组织,那么它更可能只是肠道生态变化的标志,而不是调控宿主表型的“信使”。相反,一个变化幅度并不显眼的代谢物,如果能够在肠道、血液和靶组织中呈现方向一致的变化,并进一步引起细胞和组织功能的响应,其生物学价值可能高得多。
因此,肠道微生物研究或许需要从“寻找差异最大的分子”,转向“寻找跨组织证据最完整的分子”。候选代谢物不应只在粪便中被发现,还应继续追问:它由谁产生?能否被肠道吸收?进入血液后是否仍然存在?是否到达靶组织?宿主是否对它进行了再次转化?最终又改变了什么生理过程?
一个差异不算最大的代谢物,如果能够在肠道、血液和肌肉中形成一致证据,价值可能远高于粪便中变化十倍、但根本不能被吸收的代谢物。
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