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JIA | 贵州茅台与贵州省农科院合作开发高粱47K“液相育种芯片”

已有 579 次阅读 2026-4-15 16:33 |个人分类:论文|系统分类:论文交流

高粱是全球第五大禾本科作物,也是中国白酒酿造的核心原料。然而,与玉米、水稻等作物相比,高粱一直缺乏高通量、成本可控的专用基因分型平台,制约了其分子育种进程。

近期,贵州茅台股份有限公司贵州省农业科学院旱粮研究所合作完成的题为“SbGBST47K: A high-resolution genotyping-by-target-sequencing liquid chip in sorghum”的研究在Journal of Integrative Agriculture(JIA)优先在线发表。该研究基于靶向测序基因分型(GBTS)技术,开发了一款高粱液相芯片(靶向捕获测序)SbGBST47K。

该研究基于1025份全球高粱种质的全基因组重测序数据,经多层级筛选,构建了包含47,040个SNP位点的SbGBST47K液相芯片。芯片涵盖三类标记:45,506个全基因组背景标记、1,278个通过比较等位基因频率差异筛选的酒用高粱特异性诊断标记,以及268个整合株高、单宁含量等重要性状相关位点的功能标记。对434份高粱种质的基因分型结果显示,芯片可有效区分四类遗传群体;通过GWAS鉴定到160个与粒色、单宁含量等显著相关的SNP,证实Wx和Tan2基因为籽粒品质关键基因,并在4号染色体发现粒色相关的新遗传位点。

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该芯片为高粱提供了低成本、高通量SNP分型平台,填补了高效基因分型平台空白,为种质鉴定、新品种选育及分子标记辅助选择提供了基础工具,对推动高粱分子育种技术发展、提升育种效率具有重要意义。

贵州茅台酒股份有限公司张巧玲高级工程师和贵州省农业科学院旱粮研究所丁延庆副研究员为论文共同第一作者,贵州省农业科学院旱粮研究所张立异研究员与贵州茅台股份有限公司杨帆高级工程师为论文共同通讯作者。该研究得到了贵州省基础研究计划(自然科学类)(QKHJC[2024]QN382)、国家自然科学基金(32572425)、贵州茅台酒股份有限公司科研项目(MTGF2023007)和贵州省特色杂粮生物技术育种重点实验室(QKHPT[2025]026)的资助。

Cite the article:

Qiaoling Zhang, Yanqing Ding, Yinlin Wang, Jianxia Xu, Feng Jiang, Ning Cao, Fan Yang, Liyi Zhang. 2026. SbGBST47K: A high-resolution genotyping-by-target-sequencing liquid chip in sorghum. Journal of Integrative Agriculture, Doi:10.1016/j.jia.2026.03.031

https://doi.org/10.1016/j.jia.2026.03.031

Journal of Integrative Agriculture(《农业科学学报(英文)》, JIA由中华人民共和国农业农村部主管,中国农业科学院与中国农学会主办,中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊,月刊。创刊于2002年,现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.4,位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中国科学院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持



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