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[转载]【好文荐读】MRI引导下的近红外光谱断层成像:一种结合CNN与Transformer的重建方法

已有 266 次阅读 2026-9-11 10:00 |系统分类:论文交流|文章来源:转载

乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤之一,早期精准诊断对提高生存率至关重要。近红外光谱断层成像(NIRST)作为一种无创、无电离辐射、低成本的光学成像技术,可通过量化组织内总血红蛋白等发色团浓度,为乳腺病变的良恶性鉴别提供功能性信息。然而,NIRST图像重建本质上是严重不适定的逆问题,传统方法重建质量有限。

近日,北京工业大学信息科学技术学院冯金超教授与胡婷博士团队在《Journal of Innovative Optical Health Sciences》上发表了一项突破性研究。他们提出了一种名为CNN-Trans的混合深度学习架构,将卷积神经网络(CNN)与Transformer相结合,利用MRI的结构先验信息引导NIRST重建,显著提升了图像质量和诊断性能。

Mengfan Geng, Zhe Li, Yingnan Dang, Chengpu Wei, Yuzhu Tang, Tianyue Xin, Zhonghua Sun, Kebin Jia, Ting Hu, and Jinchao Feng.A hybrid CNN-transformer network for magnetic resonance imaging-guided near-infrared spectral tomography.Journal of Innovative Optical Health SciencesOnline ReadyOpen Access

https://doi.org/10.1142/S1793545826400055

正文

研究背景:NIRST为何需要MRI“导航”?

NIRST通过测量组织表面的近红外漫射光信号,重建组织内部的总血红蛋白分布。然而,光子在生物组织中的强散射特性使得这一逆问题高度病态。将MRI结构先验引入NIRST重建过程,可以有效约束解空间,提高重建质量。

然而,现有方法存在一定局限性:基于CNN的模型虽然擅长提取局部特征,却难以建模MRI图像中的全局依赖关系;而纯Transformer模型能够建立长程依赖关系,但其计算开销大,且对细粒度的空间细节捕捉能力有限。如何兼顾局部细节与全局结构,成为提升重建质量的关键。

CNN-Trans:双编码器 + 动态特征融合

研究团队提出的CNN-Trans网络采用编码器-解码器架构,核心设计包括:

图1:CNN-Trans整体架构图。(a)模型总体结构;(b)Transformer模块;(c)动态特征融合(DFF)模块。

双分支编码器:

NIRST编码器:采用堆叠的3D卷积层(3×3×3核)结合自适应最大池化,提取NIRST测量数据中的局部特征。

MRI编码器:基于Vision Transformer(ViT),将MRI图像划分为16×16×18的非重叠三维块,通过4个Transformer块捕获全局上下文信息。

动态特征融合(DFF)模块:这是本研究的核心创新之一。DFF模块同时从通道维度和空间维度对多模态特征进行加权融合——通道注意力机制用于增强信息丰富的特征通道,空间注意力机制用于强化多模态特征中的重要空间区域。与简单的特征拼接或加法相比,DFF显著提升了多模态特征的互补性。

解码器:五级级联结构,逐步上采样并融合多尺度特征,最终输出三维总血红蛋白(HbT)浓度图像。

实验设计与结果

训练数据:研究团队从38例乳腺癌患者中选取22例患者的MRI图像来创建乳腺数字仿体,为脂肪、腺体和肿瘤组织区域赋予不同的发色团浓度,并利用NIRFAST求解扩散方程生成NIRST测量数据,最终获得了492组训练样本。

测试数据:独立于训练数据的308个仿真数据+38例患者中未参与训练的16例真实临床患者数据(11例恶性,5例良性)。

定量评估指标:MSE(均方误差)、PSNR(峰值信噪比)、SSIM(结构相似性)、HbT对比度。

仿真实验结果与三种最先进方法(TransMEF、Z-AUTOMAP、DL-MRg-NIRST)相比,CNN-Trans在所有指标上均取得最优表现:

MSE降至2.27×10⁻²,比DL-MRg-NIRST降低3.81%

PSNR提升至20.81 dB,提升1.81%

SSIM达到0.89,提升7.23%

HbT对比度达到1.41,提升2.92%

图2:不同算法在测试集仿真数据上的代表性重建结果。青色线标示肿瘤边界,红色线标示正常组织边界。

消融实验:每个组件都不可或缺

补丁尺寸:16×16×18的小补丁相比32×32×36,MSE降低38.15%,证明小补丁更有利于保留局部细节。

融合策略:DFF模块相比简单拼接,MSE降低6.58%,HbT对比度提升10.16%。

编码器结构:CNN-Trans混合架构显著优于纯CNN编码器(CNN-CNN)和纯Transformer编码器(Trans-Trans)。

临床患者验证:零微调直接泛化

最令人振奋的结果是:所有模型仅在仿真数据上训练,直接应用于16例真实患者数据,未经过任何微调或再训练

CNN-Trans以HbT对比度1.20为阈值,取得了:

  • 灵敏度 90.9%

  • 特异度 80%

  • 诊断准确率 87.5%

  • AUC 0.909

将DCE MRI与CNN-Trans的HbT对比度联合使用后,AUC进一步提升至0.945,特异度达到100%。

图5:16例临床患者的HbT对比度箱线图及ROC曲线。(a)四种模型在恶性组与良性组的HbT对比度分布;(b)DCE MRI、四种模型及MRI+CNN-Trans联合诊断的ROC曲线。

主要创新点

混合架构设计:首次将CNN(局部特征提取)与Transformer(全局上下文建模)有机结合用于MRI引导的NIRST重建,兼顾了细节保留与结构一致性。

动态特征融合模块:创新性地引入通道-空间双维度的动态加权融合机制,有效挖掘MRI与NIRST之间的互补信息。

仿真到临床的零微调泛化:仅用仿真数据训练的模型,直接在模型未见过的16例真实患者数据上取得优异的诊断性能,证明了模型强大的泛化能力和临床转化潜力。

全面的定量验证:采用MSE、PSNR、SSIM和HbT对比度四项指标,并结合仿真实验、消融实验及真实患者ROC分析,构建了完整的评价体系。

应用前景

乳腺癌早期筛查与鉴别诊断

NIRST可量化肿瘤新生血管导致的局部总血红蛋白升高。本研究证明,CNN-Trans可准确区分良性与恶性病变(AUC 0.909),为乳腺X线摄影或超声提供了低成本、无辐射的功能性补充。

多模态影像融合的普适性框架

CNN-Trans的设计思想——用一个模态提取局部特征、另一个模态提供全局结构先验——可推广至其他多模态成像组合(如PET/CT、SPECT/MRI)。

结语

本研究提出的CNN-Trans网络,通过巧妙融合CNN的局部特征提取能力和Transformer的全局上下文建模能力,并引入动态特征融合模块,显著提升了MRI引导下的NIRST图像重建质量。在仿真数据和16例真实患者数据上的验证结果表明,该方法在图像质量和诊断性能上均优于现有先进方法,且展现出优异的泛化能力。

这项工作为多模态光学成像的深度学习重建提供了新范式,有望推动NIRST技术向临床乳腺癌精准诊断迈出坚实一步。未来,研究团队计划在更大规模、更多样化的患者队列中验证该方法,并进一步优化计算效率。

通讯作者简介

冯金超,北京工业大学信息科学技术学院教授,主要研究方向为计算光学成像、微弱信号检测与智能感知、人工智能和医学成像。

更多详情见https://sist.bjut.edu.cn/info/1423/2327.htm

胡婷,北京工业大学信息科学技术学院教师。研究方向为图像处理、深度学习。

更多详情见https://sist.bjut.edu.cn/info/1423/2330.htm



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