文章导读

禽流感病毒 (Avian Influenza Viruses, AIV) 是已知的对家禽的最大威胁之一。它主要包含高致病性禽流感 (Highly Pathogenic Avian Influenza, HPAI) 和低致病性禽流感 (Low Pathogenic Avian Influenza, LPAI)。高致病性禽流感病毒主要由 H5 和 H7 亚型组成，感染这些病毒可能导致易感家禽物种 100% 死亡。低致病性禽流感病毒可导致无症状感染或表现为较轻微的呼吸道感染迹象。新型高致病性禽流感病毒毒株曾导致大规模动物流行病的爆发以及威胁人类的流行病。在世界范围内，候鸟种群既是流感病毒的巨大储库，也是新的、具有潜在高致病性的 AIV 毒株出现的场所。因此，在全球范围内持续监测当前野生候鸟流行情况的多样性非常重要，它也为监测潜在的流感病毒态势提供了必要的信息，从而能够预防新的爆发，并能够更新当前的季节性流感疫苗。

基于此，来自莫斯科物理技术学院的 Artem Blagodatski 博士及其团队在 Pathogens 期刊上发表的综述中，分析了由野生鸟类迁徙引起的 HPAI 和 LPAI 引入，以及 AIV 在环境中的稳定性、持久性和感染潜力。本文还讨论了在野生候鸟种群中监测和检测流感病毒的现有方法，以及病毒传播的建模方法。

综述内容

1. AIV 生态及其持久性和传染性

粪口途径是禽流感在鸟类之间传播的主要途径。病毒颗粒在粪便中和在环境中（主要是水生环境中）的稳定性是毒力研究和野外研究最重要的问题。主要关注的是病毒在候鸟迁徙期间过程中居住和休息的典型环境条件下可以持续存在并保持其传染能力的时间长度。研究表明，AIV 颗粒是稳定的，并且在中性或弱碱性 pH 范围内保持其感染潜力，并且感染性在 pH 6.0 以下迅速降低。因此含有 AIV 样品的存储介质的 pH 值应保持在位于 6 和 8 区间的最佳 pH 范围，并在数周至数月的时间内保持传染性。

2. 禽流感病毒采样、分析和量化方法

已知 AIV 主要在呼吸道和消化道中感染和增殖。因此，从野生候鸟身上获取含有病毒的生物材料样本的典型方法是 (i) 咽拭子，(ii) 从活的或刚死亡的鸟类身上采集的泄殖腔拭子，以及 (iii) 收集新鲜的鸟类粪便和颗粒。粪便取样可以最大限度地减少对鸟类种群的损害。但是从粪便生物材料中分离出活的 AIV 样本的概率通常低于新鲜采集的气管甚至泄殖腔拭子。因此在采集禽粪便时，为了最大限度地提高活病毒株分离的功效，需要重点关注 AIV 对环境变量的依赖性，如鸟类数量、物种多样性、温度等。

根据世界动物卫生组织发布，有两种主要的行之有效的方法检测禽类生物材料 (粪便或拭子) 中是否存在 AIV。第一种方法是粪便接种。另一种方法是使用分子技术检测甲型流感病毒特异性核酸特征的存在。需注意的是，对于大规模筛选试验，目前在接种鸡胚中进行病毒繁殖然后进行血凝试验 (图 1) 的策略被认为是病毒检测的主要方法。

图1: AIV 现场样本分析的标准协议。

3. 野生候鸟与其他流感宿主的相互作用

家禽养殖场和家禽市场是一个巨大而重要的 AIV 库，定期对家禽进行 AIV 监测对于为野生动物研究提供必要的背景知识以及全面了解人畜共患病至关重要。曾有作者通过结合病毒基因组、重建家禽运输数据，比较了 AIV 的三种主要亚型 (H5N1、H7N9 和 H5N6) 在中国的空间传播，以估计家禽贸易对 AIV 在具有复杂的家禽生产系统的发展中国家大片地理区域传播的影响。总而言之，家禽养殖场和迁徙的水禽之间的接触是 AIV 传播和重组的明显风险因素。因此需特别注意防止位于野生鸟类迁徙路线上的农场受到污染。在此类地区进行更密集的家禽疫苗接种可能具有重大的安全效益。

研究总结

禽流感仍然是世界范围内流行病和动物流行病暴发的主要来源之一。新的 HPAI 菌株的出现和进化在野生鸟类种群中更为普遍，因此研究野生鸟类的迁徙路线至关重要。从迁徙的角度来看，必须定期对重要区域进行抽样检测。新型的检测方法配合 GIS 技术，可以对 AIV 菌株进行实时跟踪。从而使我们能够控制禽流感的潜在爆发，并增加对其传播、演变和发病机制的了解 (图 2)。此外，实地考察中获得的生物材料集合可以在  CARMEN-Cas13 等多重平台上进行分析，使全国监测变得多维化，并可能为禽流感和 HPAI 人畜共患病暴发监测和预防提供新策略。

图2: 禽流感病毒生态学与研究。

原文出自 Pathogens 期刊

Blagodatski, A.; Trutneva, K.; Glazova, O.; Mityaeva, O.; Shevkova, L.; Kegeles, E.; Onyanov, N.; Fede, K.; Maznina, A.; Khavina, E.; Yeo, S.-J.; Park, H.; Volchkov, P. Avian Influenza in Wild Birds and Poultry: Dissemination Pathways, Monitoring Methods, and Virus Ecology. Pathogens 2021, 10, 630.

Pathogens 期刊介绍

主编：Lawrence S. Young, University of Warwick, UK

期刊涵盖有关病原体及病原体与宿主相互作用的相关研究，旨在为该领域提供一个前沿学术交流平台。期刊已经被 Scopus、SCIE (Web of Science)、PubMed、PMC 等数据库收录。

2021 Impact Factor：4.531

2021 CiteScore：3.5

Time to First Decision：15.9 Days

Time to Publication：38 Days