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Fundamental Research |陈福和、丁显廷等:实验噪声不再是障碍:一种更稳健的联合用药优化方法

已有 666 次阅读 2026-1-6 21:42 |系统分类:科研笔记

如何在有限实验条件下快速找到“效果最好、副作用最小”的药物组合,一直是一个难题。传统方法往往只使用重复实验的平均值进行建模,忽略了实验噪声和不确定性,导致模型不稳健、优化效率低。本研究提出了一种基于蒙特卡洛方法的回归建模新策略(ReMEMC),将实验波动本身转化为模型的一部分,通过大量随机采样和并行建模,提高对真实剂量–效应关系的刻画能力。该策略为快速、稳健的联合用药优化和个体化精准医疗提供了新工具。

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中文标题:实验噪声不再是障碍:一种更稳健的联合用药优化方法

英文原题:Tailoring Combinational Therapy with Monte Carlo Method-based Regression Modeling

通讯作者:

陈福和,香港大学李嘉诚医学院

丁显廷,上海交通大学

第一作者:

王博谦,上海交通大学

袁硕峰,香港大学李嘉诚医学院

关键词:联合用药、剂量优化、蒙特卡洛方法、回归建模、新冠抗病毒

背景介绍

为什么联合用药“难在优化”?

在治疗病毒感染、癌症等复杂疾病时,联合用药往往比单一药物更有效。但问题在于:

药物一多,组合数量呈指数级增长。

如果10种药物、每种3个剂量水平,理论上就有将近6万种组合,几乎不可能靠“试一试”全部验证。

更棘手的是,生物实验本身噪声很大。即使是同一个条件,重复实验的结果也可能相差明显。传统回归或机器学习方法通常只使用“平均值”来建模,把这些波动当作误差丢掉,结果模型容易偏、预测不稳定。

那么,有没有办法把这些不确定性变成信息,而不是负担?

研究成果

我们做了什么不一样的事?

本研究提出了一种新的建模策略——ReMEMC(基于蒙特卡洛方法的回归建模)。

简单来说,核心思想只有一句话:

不要只相信一个“平均结果”,而是承认实验本身存在不确定性,并系统性地利用它。

在具体做法上(图1),研究团队没有只用一次回归模型,而是:

⚫ 根据每个实验条件的均值和方差

⚫ 通过蒙特卡洛方法随机生成大量“可能的真实结果”

⚫ 对每一组数据分别建模

⚫ 最终得到预测结果的概率分布,而不是单一数值

这样一来,模型不仅告诉你“哪个组合最好”,还会告诉你:

⚫ 这个结论有多稳健

⚫ 哪些组合可能更有潜力,但不确定性较高

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用新冠病毒验证:两轮实验找到最优组合

为了验证该方法在真实问题中的效果,研究以 SARS-CoV-2(新冠病毒) 作为模型疾病。研究者从已有研究中选取了10种已知具有抗病毒活性的候选药物,包括小分子药物和干扰素。

面对数万种可能组合,ReMEMC的表现非常“高效”(图2):

⚫ 第一轮实验:测试36种组合,建立初始模型

⚫ 第二轮实验:在模型指导下,再测试36种更有潜力的组合

⚫ 最终结果:仅用两轮实验,就锁定了一种三联用药方案

该最优组合的病毒载量降低效果:

⚫ 比非优化组合高 2个数量级

⚫ 比单药治疗高 3个数量级

换句话说,在实验成本极其有限的情况下,算法成功“指路”,避免了大量无效试验。

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不只是“更准”,而是“更快、更稳健”

相比传统回归方法,ReMEMC的优势体现在三点:

1. 对实验噪声更不敏感

实验波动不再破坏模型,而是被纳入预测本身。

2. 实验效率显著提高

不需要成倍增加重复实验,就能获得可靠结论。

3. 非常适合个体化治疗

研究团队进一步提出,通过流程优化,5天内即可为单个患者筛选个体化联合用药方案,这在急性感染或耐药患者中具有现实意义(图3)。

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未来展望

这项工作意味着什么?

这项研究并不是在“再造一个复杂算法”,而是提供了一种更符合生物实验现实的思路:

当不确定性不可避免时,不妨正视它、利用它。

ReMEMC方法不依赖具体疾病机制,理论上可推广至:

⚫ 抗肿瘤联合用药

⚫ 细菌耐药问题

⚫ 精准医学中的个体化方案筛选

它为“如何在有限实验条件下做出更聪明决策”提供了一个可复制的范式。

引用本文

Boqian Wang, Shuofeng Yuan, Chris Chun-Yiu Chan,  et al.Tailoring combinational therapy with Monte Carlo method-based regression modeling. Fundamental Research5(6) (2025) 2975-2982.

原文链接(复制到浏览器中查看):https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2667325823000894

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