250 多年前，卡尔·林奈创建了现代植物分类；一个世纪后，查尔斯·达尔文提出所有物种都来自于一个共同的祖先的理论，并建立了“生命图谱”——基于生物个体之间相似性与差异性绘制出的生物间层级关系。从那时起，植物学和生态学领域的研究人员一直试图将植物间的关系映射到进化树上，以勾勒其进化轨迹。

维管植物是指通过维管组织在体內运输水分和养分的植物。世界上 357,000 种此类物种中只有大约 20% 被测序过。这致使很多的植物学家和生态学家需要依赖“巨树方法”来建立植物进化树，用其来反映物种之间的进化关系。

早在 2015 年，美国伊利诺伊州立博物馆的钱宏博士就萌生了创建生成植物进化树的软件包的想法，并与金毅博士合作先后开发出两个免费R语言软件包，一个用于种子植物（S.PhyloMaker )，一个用于维管植物 (V.PhyloMaker)。这两个软件包已被业内研究人员广泛使用。钱博士说：“该软件自推出以来被广泛应用，这表明该软件对于研究人员是有实用性的。”然而，这两个软件都存在着一个缺陷：“这两个软件包中所使用的进化树中的植物名称虽然来源于标准化的植物名录The Plant List（基本囊括了所有已知植物物种名称），但该名录自 2013 年至今未被更新过，也就是说这些信息就当前及未来的研究而言已经过时。考虑到最近推出的几个全球植物数据库，我们认为现在是更新原有软件的时候了，特别是V.PhyloMaker这个软件包 ”钱博士解释道。

最近，金博士和钱博士在期刊Plant Diversity发表了一篇名为V.PhyloMaker2: An updated and enlarged R package that can generate very large phylogenies for vascular plants的文章，在文章中，金博士和钱博士介绍了V.PhyloMaker软件包的最新版本——V.PhyloMaker2：此升级版本在保留V.PhyloMaker中原有植物进化树的基础上，添加了基于两个新的植物术语数据库（莱比锡维管植物目录数据库和世界植物数据库）的进化树。钱博士指出：“V.PhyloMaker2可以产生基于最新植物名录的更完备的进化树，帮助研究人员生成更可靠的进化树，从而得出更精准的研究结果。”