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aBIOTECH | 北京林业大学王厚领团队综述植物无转基因基因组编辑技术

传统基因组编辑技术(如CRISPR/Cas9)通常依赖农杆菌转化或质粒DNA递送,虽然能够实现高效靶向修饰,但外源DNA片段(如TDNA、抗性标记)会随机整合到植物基因组中。这不仅可能引发脱靶突变和基因组干扰,还会导致最终产品被归为转基因生物,在监管审批与公众担忧方面带来较大挑战。在此基础上,无转基因基因组编辑(transgenefree genome editing)技术应运而生。其核心思路是避免任何外源DNA的稳定整合,仅通过瞬时递送CRISPR组分(如Cas9蛋白sgRNA复合物或编码编辑器的mRNA)完成靶点修饰,随后编辑元件被细胞内源机制快速清除。由此获得的植物不携带任何外源DNA片段,在法规上可被认定为非转基因,从而大幅加速优良性状作物的育种与商业化进程。
近日,北京林业大学王厚领副教授课题组在aBIOTECH 发表了题为“Transgenefree genome editing in plants”的综述论文。该综述系统总结了植物中无需外源DNA整合的无转基因基因组编辑技术的核心原理与应用进展,重点介绍了核糖核蛋白(RNP)直接递送、mRNA瞬时表达、单碱基编辑及引导编辑等策略在避免外源DNA整合、降低脱靶风险及加速非转基因作物商业化方面的突破性优势。文章还梳理了原生质体再生、基因枪、纳米材料、病毒载体等多元递送系统以及可视化筛选、共编辑筛选等高效鉴定方法,并对人工智能辅助设计、表观编辑及低成本育种应用等未来发展方向进行了展望。
三大类实现无转基因编辑的主要技术路径:
(1)直接递送核糖核蛋白(RNP)复合物:通过体外预组装Cas9蛋白与sgRNA形成RNP,再借助PEG介导的原生质体转染、基因枪轰击、脂质体或细胞穿膜肽等方式导入植物细胞(图1)。RNP无需转录和翻译,进入细胞后立即发挥编辑功能,并快速降解,极大降低了外源DNA整合与脱靶风险。目前该策略已在水稻、小麦、生菜、马铃薯、葡萄、杨树等多个物种中获得成功。
(2)mRNA瞬时递送:通过体外转录获得编码Cas9或碱基编辑器的mRNA,利用脂质纳米颗粒(LNP)、基因枪或新型v2_TMV/DEN2系统导入细胞。mRNA在核糖体中直接翻译为编辑器蛋白,完成靶向修饰后连同mRNA一起被降解。
(3)碱基编辑与引导编辑:胞嘧啶碱基编辑器(CBE)和腺嘌呤碱基编辑器(ABE)可在不产生DNA双链断裂的情况下实现C→T或A→G的单碱基替换。引导编辑(prime editing)则利用nCas9反转录酶融合蛋白和pegRNA,实现小片段的替换、插入或删除。这些精度编辑器与RNP/mRNA递送相结合,已在水稻、小麦、玉米、花生、番茄中成功获得无转基因的精准编辑植株。

图1. 借助多种递送系统实现无转基因基因组编辑
多元递送系统与高效筛选方法:
(1)原生质体再生:去除细胞壁的原生质体可通过PEG、脂质体、电穿孔或穿膜肽高效导入RNP/mRNA,随后再生细胞壁并分化成完整植株。生菜中BIN2基因编辑效率高达46%,且未检测到脱靶。
(2)基因枪与纳米材料:金纳米颗粒、可降解聚合物(PLGA)、DNA折纸及碳纳米管等纳米载体可避免传统金属粒子的细胞损伤,并实现可控释放和细胞特异性递送。例如,单壁碳纳米管递送siRNA在烟草中达到95%的基因沉默效率。
(3)病毒载体:负链RNA病毒(如TSWV、SYNV)可容纳完整CRISPR/Cas模块,无需转基因植物即可实现瞬时编辑。TSWV载体在番茄中编辑效率高达78.2%,SYNV载体在烟草PDS基因中达到91%的突变率。
(4)筛选策略:对于无抗性标记的瞬时系统,共编辑内源标记基因(如ALS、PDS)成为关键。利用ALS除草剂抗性共筛选或PDS白化表型共编辑,可快速富集阳性事件(图2)。此外,荧光标记(GFP、DsRed)、RUBY色素系统以及主动消除系统(TKC、FMPKC)均能有效分离无转基因的编辑植株。

图2. 以ALS基因为例,经双重筛选实现无转基因基因组编辑
尽管无转基因编辑技术取得了长足进展,但仍面临编辑效率低、再生基因型依赖、大片段精准插入困难等瓶颈。综述最后提出了若干未来发展方向:
(1)人工智能辅助设计:深度学习模型已可预测碱基编辑脱靶(DeepBaseEditor)和引导编辑效率(DTMPprime),蛋白语言模型有望理性优化编辑器组分,减少实验试错。
(2)表观基因组编辑:利用dCas9SunTag系统靶向DNA甲基化或组蛋白修饰,可在不改变DNA序列的前提下调控基因表达,实现真正 “无痕” 的性状改良。该技术已在拟南芥中成功实现多位点甲基化编辑。低成本、高通量育种应用:发展免组织培养的递送方法(如CDB嫁接、花粉管导入)和简化的分子检测流程,使无转基因编辑能够在资源有限的实验室和地区推广应用,加速本地特色作物的抗逆高产育种。
(3)整合多组学与设计构建测试学习循环:将 “设计递送再生 / 筛选” 数据流与多组学、表型组、基因组选择平台整合,推动无转基因编辑成为标准化、可预测的育种工具。
无转基因基因组编辑技术突破了传统转基因的法规与安全壁垒,为精准作物改良开辟了全新路径。随着递送系统、编辑工具及筛选方法的持续优化,以及人工智能、表观编辑、纳米技术的深度融合,该领域将有望在抗逆、高产、优质农林作物的培育中发挥核心作用,为保障粮食安全与农业可持续发展提供重要技术支撑。
北京林业大学林木遗传育种全国重点实验室/生物科学与技术学院王厚领副教授为该论文通讯作者,高悦豪为第一作者,林淇、王宇婧、曹豫、李欣芯、岳典辰为论文共同作者。该工作得到了北京市自然科学基金、农业生物育种国家重大科技专项、国家级大学生创新训练计划等项目的资助。
引用本文:
Gao Y-H, Lin Q, Wang Y-J, Cao Y, Li X-X, Yue D-C, et al. Transgene‐free genome editing in plants. aBIOTECH 2026:100057.
https://doi.org/10.1016/j.abiote.2026.100057
aBIOTECH已于2026年1月正式转至Elsevier以金色OA模式出版,最新投稿地址:
https://www.sciencedirect.com/journal/abiotech
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