纯净的有机分子的结构可以通过其化学结构式来定义，由于是纯净物，其结构式是单一的，并且这一类分子的性质取决于其结构。

        对于微观不均一性分子，情况就不同了，这一类分子包含着巨大数目的不同结构式，如何去定义这一类分子的结构呢？

        一个比较合理的方案是通过其所属的结构空间来定义。这里的一个“结构空间”，包含了一个基本的结构骨架，以及其上所连接的可能的取代基的个数及种类。其中包含着数目众多的异构体，总异构体的个数是确定的，可以通过精确计算得到。每个异构体的具体结构式是可以进行一一描述的。来自这样一个已完整定义的结构空间的分子，如同生物学中的一个“物种”中的不同个体一样，每个分子的具体结构式虽然不同，但十分相似，并且由该空间中的分子所形成的聚集体的宏观性质是均一且恒定的。这样的一个“结构空间”，就相当于纯净物中的一个“结构式”。

       总之，结构空间这一概念，对于理解微观不均一性分子的结构，是十分重要的。如同纯净物分子的结构是无穷多的一样，结构空间的数目也是无穷多的，构建一个理论异构体数目足够多的结构空间，通过等概率随机合成法合成出一小部分其中所包含的分子，是制备微观不均一性分子的一条基本途径。