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[转载]Poultry Science||长顺绿壳蛋鸡产蛋期至孵化期下丘脑转录组谱

已有 130 次阅读 2026-6-9 14:25 |系统分类:论文交流|文章来源:转载

本研究利用RNA-Seq技术比较了长顺绿壳蛋鸡在产蛋期（LP）和抱窝期（BP）下丘脑的转录组差异，共鉴定出 942个差异表达基因（DEGs）（637个上调，305个下调）。KEGG富集分析显示，神经活性配体-受体相互作用、Hippo信号通路和黏着斑通路显著富集。通过PPI网络筛选出 POMC、IGF1R、CHAD、VCL、MYL9 等枢纽基因，qPCR验证确认了POMC、FST、VIP、UCN3的表达趋势与测序结果一致。结果表明，下丘脑通过复杂的神经内分泌网络调控抱窝行为的启动和维持。

1题目

文章题目：Hypothalamic transcriptome profile from laying period to incubation period of Changshun green-shell laying hens

发文单位：黔南民族师范学院（生物科学与农学院）、贵州省黔南州畜禽应用生物技术重点实验室

研究对象：长顺绿壳蛋鸡，重点关注其下丘脑组织

研究领域：家禽神经内分泌学、繁殖行为转录组学

2杂志

Poultry Science

3链接

Chen, Z., Wen, D., Cen, J., & Mu, R. (2024). Hypothalamic transcriptome profile from laying period to incubation period of Changshun green-shell laying hens. Poultry Science, 103, 103950.

https://doi.org/10.1016/j.psj.2024.103950

4检测方法

Norminkoda提供了qPCR检测

5主要内容

实验设计：选取产蛋期（有等级卵泡）和抱窝期（无等级卵泡+行为确认）母鸡各4只，采集下丘脑进行转录组测序。

数据质量：测序数据Q30 > 94.79%，基因组比对率 > 93.5%，数据可靠。
差异分析：PCA显示LP与BP组明显分离，共获得942个DEGs。

通路富集：

关键通路：神经活性配体-受体相互作用（含VIP、HCRT、UCN3等）、Hippo通路、黏着斑通路。
GO分类：主要集中在细胞过程、生物调控、结合活性等。

枢纽基因：构建PPI网络，发现 POMC（食欲与能量平衡）、IGF1R（生长与繁殖）、CHAD/VCL/MYL9（细胞黏附与骨架）处于网络核心。
实验验证：qPCR验证了 POMC（上调）、FST（上调）、VIP（上调）和 UCN3（下调）的表达，与RNA-Seq结果一致。

主要结论

下丘脑主导：长顺绿壳蛋鸡的抱窝行为转变伴随着下丘脑转录组的剧烈重编程。
关键信号：神经活性配体-受体相互作用是调控抱窝的核心通路，VIP（促乳素释放因子）的上调与PRL分泌增加导致的抱窝行为直接相关。
候选基因：POMC 和 IGF1R 是连接能量代谢（抱窝期厌食）与繁殖行为的关键枢纽基因。
品种特异性：研究揭示了地方鸡种（绿壳蛋鸡）抱窝行为的复杂分子基础，为通过遗传手段选育“低抱窝性”高产品种提供了靶点。

6总结

抱窝（Broodiness） 是家禽的重要母性行为，但会导致产蛋停止，造成经济损失。该研究从下丘脑（神经内分泌整合中心）入手，填补了地方鸡种在此领域的转录组空白。
VIP-PRL轴的验证（VIP表达升高）与经典理论吻合，解释了抱窝期高PRL、低LH的生理现象。
POMC的上调可能与抱窝期厌食（食欲减退）和能量分配有关，这是行为转变的重要生理代价。
文章的价值在于提供了长顺绿壳蛋鸡这一特定模型的基因清单（如CHAD、VCL），为后续功能验证（如基因敲除或过表达）奠定了基础。