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做完qPCR实验,拿到一堆Ct值,很多人会有点懵:这些数字到底是什么意思?怎么判断我的样本是端粒酶阳性还是阴性?
别担心,今天我们就来详细讲讲翼和生物端粒酶检测试剂盒的结果判读方法,教你如何正确解读Ct值。
什么是Ct值?在讲判读之前,我们先简单回顾一下什么是Ct值。
Ct值(Cycle threshold),即循环阈值,是指荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。简单来说,Ct值越小,说明起始模板浓度越高,因为只需要较少的循环就能达到阈值;Ct值越大,说明起始模板浓度越低。
一般来说,Ct值每相差1,模板浓度就相差约2倍(假设扩增效率为100%)。
翼和的试剂盒检测两个基因:TERT基因(FAM通道)和内参基因GAPDH(Cy5通道)。两个基因各有一个Ct值。
第一步:判断实验是否有效拿到结果后,第一步不是看样本,而是先看对照,判断这次实验是否有效。
如果对照都不正常,那样本的结果也就不可信了。
阳性对照的判断标准:
○ 4倍稀释后:TERT基因Ct值在25±3范围内,内参基因Ct值在17±3范围内。
○ 8倍稀释后:TERT基因Ct值在26±3范围内,内参基因Ct值在18±3范围内。
○ TERT基因和内参基因之间∆CT维持在9±3范围内,保持稳定。
简单理解就是:阳性对照的TERT和内参都应该有正常的扩增曲线,Ct值在预期范围内,而且随着稀释倍数增加,Ct值相应增加,∆Ct保持稳定。
阴性对照的判断标准:
○ 经4倍、8倍梯度稀释后,TERT基因Ct值≥35(或检测不到,即No Ct)。
○ 内参基因Ct值仍在18±3之间。
简单理解就是:阴性对照的内参应该正常扩增,但TERT基因应该没有扩增,或者Ct值很大(≥35)。
空白对照的判断标准:
○ TERT基因和内参基因都应该检测不到(No Ct)。
空白对照如果出峰了,说明体系有污染,实验结果不可靠。
只有当所有对照都符合标准时,这次实验才是有效的,样本的结果才可信。
第二步:判断样本RNA质量和反转录是否成功实验有效之后,第二步是看样本的内参基因,判断RNA质量和反转录是否成功。
内参基因GAPDH是管家基因,在所有细胞中都应该有表达。如果内参都没出峰,说明RNA降解了,或者反转录失败了,那样本的结果就不可信。
内参判断标准:
○ 待测样本4倍稀释后,内参基因Ct值在14~20之间(或17±3之间)。
○ 扩增曲线正常,呈典型的S型曲线。
如果内参Ct值太小(比如小于12),说明cDNA浓度太高,可能会有抑制作用;如果内参Ct值太大(比如大于22),说明RNA浓度太低或者质量不好,都可能影响结果的可靠性。
第三步:判断样本端粒酶活性阴阳确认实验有效、内参正常之后,第三步就是看TERT基因的Ct值,判断样本的端粒酶活性是阳性还是阴性。
阳性判断标准:
○ 内参基因Ct值在14~20之间(正常)。
○ TERT基因Ct值<35。
○ TERT基因的扩增曲线正常,呈典型的S型曲线。
同时满足这三个条件,就可以判断样本的端粒酶活性为阳性。
阴性判断标准:
○ 内参基因Ct值在14~20之间(正常)。
○ TERT基因Ct值≥35,或者检测不到(No Ct)。
○ TERT基因无明显的扩增曲线,或者只有很弱的非特异性信号。
同时满足这三个条件,就可以判断样本的端粒酶活性为阴性。
灰色地带怎么处理?有时候可能会遇到一些"灰色地带"的情况,比如TERT的Ct值在34-36之间,或者扩增曲线不太典型。这时候该怎么判断呢?
建议:
a. 看扩增曲线:Ct值只是参考,更重要的是看扩增曲线的形状。正常的扩增曲线应该是平滑的S型,有明显的基线期、指数期和平台期。如果曲线歪歪扭扭,或者只有很微弱的信号,那很可能是非特异性扩增。
b. 看溶解曲线(如果是SYBR Green法):如果有溶解曲线,可以看溶解峰是否单一,是否在预期的Tm值位置。不过翼和的试剂盒是TaqMan探针法,一般不需要做溶解曲线。
c. 重复实验:如果结果不确定,建议重复实验验证。有时候一次实验可能有偶然因素。
d. 结合其他信息:结合样本的类型、预期的结果等综合判断。比如正常的间充质干细胞应该是阴性的,如果检测出弱阳性,就要怀疑是不是有污染或者操作问题。
关于定量分析翼和的试剂盒不仅可以定性判断阴阳,还可以进行相对定量分析。
如果你需要比较不同样本之间端粒酶活性的高低,可以用∆Ct法或者∆∆Ct法进行相对定量。
简单来说:
○ ∆Ct = TERT Ct值 - 内参Ct值。∆Ct越小,说明TERT的相对表达量越高,端粒酶活性越强。
○ ∆∆Ct = 处理组∆Ct - 对照组∆Ct。然后用2^(-∆∆Ct)计算相对表达倍数。
不过要注意,相对定量的前提是扩增效率一致,而且内参基因的表达稳定。
常见问题
Q:为什么我的样本内参很亮,但TERT没有信号?
A:如果是正常体细胞或者间充质干细胞,这是正常的,因为这些细胞本来就没有端粒酶活性。如果是肿瘤细胞或者阳性对照也没有信号,那就要检查实验操作是否有问题。
Q:为什么我的阴性对照TERT也出峰了?
A:这很可能是污染了。检查一下操作过程中有没有交叉污染,试剂有没有被污染,枪头、离心管等是否无菌无酶。
Q:Ct值的范围一定要严格遵守吗?
A:说明书上的Ct值范围是参考值,是在特定的实验条件下得到的。不同的仪器、不同的试剂批次,Ct值可能会略有差异。关键是看对照是否正常,以及扩增曲线的形状。
总结结果判读三步走:先看对照判断实验是否有效,再看内参判断样本质量,最后看TERT判断阴阳。按照这个流程来,就能正确解读端粒酶检测的结果了。
翼和生物的试剂盒提供了明确的判读标准和详细的操作指导,让你的实验结果解读不再困难。
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GMT+8, 2026-10-22 14:01
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