||
当通过高通量测序筛选出候选阳性突变后,往往需要在成百上千的大样本队列中进行验证,以评估其频率、与表型的关联性或临床诊断效能。如何选择一种既经济又可靠、既灵敏又高通量的验证方法?我们提供两种主力技术方案:PCR联合连接酶检测反应(PCR-LDR)适用于已知位点的高通量分型;多重PCR扩增子捕获+二代测序则兼顾已知和未知位点、可并行检测数百个扩增子。
为什么需要专门的队列验证技术?在突变发现阶段,NGS虽然强大,但成本依然较高,且针对少量位点进行大样本全基因组/外显子测序的投入产出比不佳。因此,对已明确的少数候选位点进行大规模人群或样本队列的基因分型/突变筛查,需要采用中通量、低成本、高准确性的靶向技术。理想的技术应满足:可扩展性、灵敏度和特异性、经济高效。
我们提供的两种核心服务——PCR-LDR和多重PCR扩增子捕获+二代测序——正是基于这些需求设计,已在大量临床与科研队列项目中得到验证。
方案一:PCR-LDR
准确率高:连接酶的识别特异性,能准确区分SNP、点突变。
低成本:无需测序仪,仅需普通PCR仪和毛细管电泳仪,实验成本较低。
检测灵活:能根据不同的检测需求进行调整,单次操作可处理几个到上百个样本。
方案二:多重PCR扩增子捕获+二代测序
超高通量:平均测序深度超过1000X,能够同时对成百上千的位点进行检测。
检测范围广:可对SNP位点以及周围序列进行测序,更准确,更灵敏。
测序质量高:测序质量Q30>90%,检出率超过95%。
结语队列验证是连接“突变发现”与“功能/临床意义”的桥梁,选择合适的技术平台决定项目效率、数据质量和最终结论的可信度。无论您需要经济高效的已知位点大规模分型(PCR-LDR),还是灵活深度的靶向区域测序(多重PCR+二代测序),我们都将用专业的技术、严谨的质控和贴心的服务,为您的队列验证项目保驾护航。让我们携手,将候选突变转化为可发表的科学发现和可落地的临床标志物。
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2026-6-12 15:10
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社