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细胞系STR鉴定的标准和数据库资源

已有 480 次阅读 2025-10-11 23:29 |个人分类:细胞|系统分类:科研笔记

为什么进行细胞系STR鉴定?

细胞系STR鉴定主要用于确保细胞身份的准确性和纯度,避免因交叉污染或错误使用细胞系导致实验结果偏差。之前一些已经发表的期刊的文章也曾使用了错误的细胞品系,导致实验结果的偏差。ATCC等国际机构将STR鉴定作为细胞鉴定的标准方法,要求实验室在发表文章前必须完成鉴定。一些重要的期刊也要求提供细胞鉴定的报告

 

细胞系鉴定相关的组织、机构以及标准

ANSI/ATCC ASN-0002-2011由美国国家标准学会 US-ANSI 发布于 2011,标准设立了人类细胞系身份认证检测的最佳方法,ANSI/ATCC ASN-0002-2021版本是其更新版本。

ATCC成立于1925年,是一家非盈利生物标准品资源中心。ATCC向全球发布其获取、鉴定、保存及开发的生物标准品。

国际细胞系身份认证委员会(ICLAC,The International Cell Line Authentication Committee)是2012年成立的组织,该组织建立有网站,用于登记交叉污染细胞及错误鉴定的细胞。强化大家使用正确细胞的认识,促进细胞身份认证检测开展,减少及至杜绝错误细胞的使用。

细胞系品系相关网站,Cellosaurus 网站2025年8月更新的资料显示包含122193 human细胞系, 30558 小鼠细胞系, 3191 大鼠细胞系的信息。

以上组织、机构、网站在细胞系的鉴定和认证、查询方面起了重要的作用,在细胞鉴定领域做出了很大的贡献,并且与时俱进不断的更新数据。

 

什么情况下需要做细胞系鉴定?

1)实验室刚购买的细胞系;

2)新构建的细胞系;

3)来源可疑的细胞系;

4)实验项目开始前;

5)细胞系长期冻存后,准备再次使用前;

6)细胞系传代次数超过5代以上;

7)文章发表投稿前;

8)细胞系表型出现异常变化

 

细胞系鉴定时交叉污染确认

细胞品系STR鉴定不但可以确认细胞系的身份,也能在检测中发现是否存在交叉污染,一般来说,若STR分型图谱两个以上的STR位点同时出现了多等位基因的现象,提示细胞系可能存在交叉污染,当然特殊细胞系除外。

 

人源和鼠源细胞系STR鉴定相关的位点

人源细胞系STR鉴定比对的核心位点数量是9个或13个,包含了很多STR位点,ANSI/ATCC ASN-0002-2011标准中包含9个位点:Amelogenin、CSF1PO、D5S818、D7S820、D13S317、D16S539、TH01、TPOX、vWA,其中Amelogenin是性别相关的位点。更新的ANSI/ATCC ASN-0002-2021标准中包含了13个位点:CSF1PO、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、FGA、TH01、TPOX、vWA,不包含Amelogenin位点,但是也将Amelogenin作为性别相关的位点。翼和生物检测的位点更多,包括Amelogenin位点和其他的20个相关位点。除了上述的13个位点之外,翼和生物检测的STR位点还包括D1S1656、D2S1338、D6S1043、D12S391、D19S433、Penta D、Penta E 这7个额外的位点,提升了人源细胞的鉴定能力。

鼠细胞系STR鉴定一般来说位点数量是8个或18个,一般说来包含8个STR位点:4-2、6-4、6-7、5-5、12-1、18-3、15-3、X-1。18个位点则是在以上基础上增加10个位点:1-1、2-1、17-2、11-2、8-1、19-2、7-1、1-2、13-1、3-2 位点。翼和生物检测鼠源细胞的18个STR位点,提升了鼠来源细胞的鉴定能力。

 



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