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本博客主要为科研笔记,旨在记录数据分析方法,欢迎指正。

方向: 物种适应性、分布与进化

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简短笔记一则:查找并删除重复文件 2017-02-21
2017年第一则 1, Linux Ubuntu, Mint下, 删除重复文件推荐使用fdupes 安装: sudo apt-get install fdupes 删除某一个文件夹下的重复文件: dupes ...
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基于地理坐标提取地图中的属性信息 2016-12-14
基于地理坐标提取地图中的属性信息 问题:现有全国范围内的样地分布地点,已知它们的WGS84经纬度,如何用R从植被分区图中提取每个点的植被分区信息? ...
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通过数码照片以及GPS航迹绘制物种分布图 2016-11-25
在植物学或者生态学调查中, 获得物种的准确位置以及绘制珍稀种或目标种在所调查区域的分布图往往十分重要。 这里以Windows 10为例, 介绍如何基于GPS航迹文件 ...
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海南大学报告:什么是系统发育比较分析? 2016-11-16
应海南大学园艺学院丁琼博士和任明迅教授邀请, 本人向从事系统发育分析的研究生介绍了什么是系统发育比较分析.以下为报告内容(幻灯片为英文) What is Phyloge ...
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用herblabel程序包打印不同风格的植物标本标签 2016-11-15
关于herblabel程序包的介绍, 请参考 http://www.biodiversity-science.net/CN/abstract/abstract10290.shtml herblabel程序包输出不同的标签样式, 目前 ...
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Rmarkdown与R的动态统计报告 2016-09-21
R的Sweave函数是用来生成动态统计报告的函数:如果将R代码包括在统计结果的Latex源代码中,用Sweave处理后, 就可以生成包含相应代码以及统计结果的统计报告, ...
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生态学和进化的重要链接EcoEvoLinks 2016-06-07
网址 https://github.com/helixcn/EcoEvoLinks Journals Research Groups/Network Macroecology and Biogeography Biodiversity and Globa ...
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R系统发育比较分析快速参考V1.0.1 2016-05-30
R语言系统发育比较分析快速参考V1.0.1     R_phylogenetics_Reference.zip Latex 源代码和PDF最新版本参见 https://github.com/helixcn/ ...
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[转载]A Simple GNU Makefile Tutorial 2016-05-18
A Simple GNU Makefile Tutorial http://www.cs.colby.edu/maxwell/courses/tutorials/maketutor/ Makefiles are a simple way to organize code comp ...
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那一刻之后 汶川大地震八周年祭 2016-05-12
《那一刻之后》 -- 汶川大地震八周年祭 八年了, 这世界有了多少改变? 多少生命定格在那一刻? 那一刻之后, 我们关注, 我们哭泣, 我们倾自 ...
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《R编程与进化分析》幻灯片(2016年5月9日 北京) 2016-05-08
受中国科学院植物研究所赖江山博士邀请, 本人于2016年5月9日在北京昌平讲解《R编程与进化分析》。 幻灯片如下 PCM_00.pdf PCM_01.pdf PCM_02.p ...
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[转载]Latex 编译R程序包时找到Sweave.sty 2016-05-04
Sweave.sty是R文档的Latex格式文件, 在编写程序包时, 如果在window下用MikTex生成R帮助文档时,找不到Sweave.sty, 可以用如下方法更新: http://tex.st ...
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个人简历的Latex模板 2016-04-21
用Latex制作的简历 风格 清爽 。 这里给出本人中文简历的源代码。 请将 代码拷贝到纯文本文件中,并用UTF8 编码。 在Linux Mint下, 完整安装TexLive ...
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在R中绘制进化树:ggtree学习笔记 2016-04-10
在R中绘制进化树:ggtree学习笔记 ggtree 是香港大学公共卫生学院在读博士生余光创先生编写的 R 程序包。 ggtree 将进化树看做点拓扑关系的集合, 绘制进 ...
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ggplot2绘图学习笔记: 数据,图层与统计变换 2016-04-10
ggplot2绘图学习笔记: 数据,图层与统计变换 主要参考 https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2015/03/ggplot2-cheatsheet.pdf ggplot2 是 R ...
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[转载]基于R语言生物多样性数据分析培训班预通知 2016年10月北京 2016-04-07
基于 R 语言生物多样性数据分析 培训班预通知 ( 2016 年 10 月 9 日, 15-18 日,北京) 随着新的数据分析方法在生态学与生物多 ...
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克里格空间插值Kriging及其在R的实现 2016-03-23
克里格是一种空间插值的方法. 克里格插值, 是法国地统计学家 Georges Matheron ( 1930 - 2000 ) 基于南非工程师 Danie G. Krige ( 1919 - 201 ...
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R编程的一些规则与建议 2016-02-01
R编程的一些规则与建议 使用R软件进行统计分析, 必须要接触R脚本. R脚本是保存了R代码的文本文件, 一般以.R为扩展名. 要高效得进行代码的编写和调试, 需要一 ...
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