记录POVME3.0使用过程遇到的一个bug 2024-06-02

POVME3.0可以计算分子动力学过程中，蛋白的活性口袋体积大小的一个小程序。它可以根据配体小分子的名字来定义活性口袋，将配体小分子周边的氨基酸残基识别为活 ...

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在MaterialStudio中构建Pd147方法 2020-04-15

     在计算金属纳米粒子催化的各类反应中常常需要构建各种类型的纳米金属团簇，本文将构建截断八面体Pd147结构的方法简单记录。具体构建过程如 ...

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MaterialStudio & Gaussian中构建反应过渡态输入文件的方法 2020-04-15

0.   化合物结构的构建，化合物结构的构建可先在ChemDraw中绘制平面结构并保存为cdx格式文件，保存后cdx文件用Chem3D打开，在Chem3D中使用Calculations ...

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