猜想的终结 2019-09-04

2019-09-03 17:15:54 大约十多年前吧, 张志东博主关于三维易辛模型精确解的博文 激辩猜想 煞是热闹, 洋洋洒洒十几篇, 可谓盛况空前. 我那时尚未关心科学网 ...

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物美价廉：GROMACS 2018在GPU节点上的使用 2019-08-29

原文  More bang for your buck: Improved use of GPU nodes for GROMACS 2018, DOI: 10.1002/jcc.26011 2019-08-28 16:47:25 翻译: 刘玉杰; 校对: ...

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吴伟：auto-martini的安装和使用简介 2019-08-06

2019-08-05 17:50:22 在文献 Tristan Bereau, Kurt Kremer; Automated Parametrization of the Coarse-Grained Martini Force Field for Small Organic Mo ...

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gmx_mmpbsa使用说明 2019-08-02

2019-07-31 10:14:58 缘起 很多年后, 当我再次更新这个工具, 就会记起, 很多年前, 我开始研究GROMACS中MMPBSA实现方法的情境. 那时的我就已经发现已有了 ...

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许楠：使用GAFF力场参数化小分子的自动化工具 2019-07-16

2019-07-14 16:11:39 许楠 AMBER  系的  GAFF  力场参数化有机小分子很有优势, 但是处理流程稍显复杂, 如图1. 笔者开发了用于自动化 ...

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复杂误差传播的计算 2019-05-13

2019-05-13 05:47:58 在数据处理中, 有时我们需要根据拟合参数的误差计算相应变量的误差, 也就是计算 误差传播 . 对于简单的模型, 计算比较简单, 可以手动 ...

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GROMACS分析教程：水分子序参数的计算 2019-04-21

2019-04-21 06:37:43 整理: 李赟, 刘庭崧; 统稿/代码: 李继存 水分子的序参数有很多种, 不同序参数的计算方法也不尽相同. GROMACS自带的分析程序 gmx h2or ...

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外国物理学家的故事 2019-04-02

2019-04-01 18:40:39 收到后, 总觉得比印象中的轻薄不少 这么薄薄的一本, 实在很不起眼 或许是因为记忆中的那本是旧书, 被人翻得多吧 也或许是因为 ...

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