Install python package without root (pip安装到指定目录)

刘洪波 2018-9-30 23:26

_______________ 方法1 (亲测有效)_______________ pipinstall--userpackage _______________ 方法2 _______________ pipinstall--install-option=--prefix=$HOME/localpackage _______________ 方法3 _______________ 用户 ...

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快速绘制染色体区域信息

刘洪波 2018-9-30 23:26

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/tools/gdp/

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PHP7 升级后Mysql报错的解决方案

刘洪波 2018-9-30 23:24

近期GoDaddy莫名其妙的自动升级了PHP版本（5.*7.*），导致Mysql数据库无法连接，这一错误的根源在于原有网页采用了mysql_connect，而PHP7将不再支持该模块，因此需要将网页中的mysql_connect更新为MySQLi或者PDO_MySQL，详情参考：http://php.net/manual/en/function.mysql-connect.php 解决办法：将原代码中 ...

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安装 R-3.5.0

刘洪波 2018-9-30 23:22

Error: checkingforzlib.h...yes checkingifzlibversion=1.2.5...no checkingwhetherzlibsupportsuffices...configure:error:zliblibraryandheadersarerequired Try: h ...

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从一则招聘启事看生物信息研究者应掌握的十种能力

刘洪波 2018-9-30 23:21

Introduction （招聘原文）： Several full-time postdoctoral positions are immediately available for Ph.D. graduates with experience in Bioinformatics (computational genomics) at the Bioinformatics Core, Cancer Science Institute of Singapore. The focus of the core is on understanding computa ...

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Linux实用命令

刘洪波 2018-9-30 23:17

1、查看系统访问日志（实时） tail --lines=100 -f /var/log/secure 2、按列合并文件 pastefile1file2 combind.txt 3、按行合并文件 cat file1file2 combind.txt 4、 Linux：使用awk命令获取文本的某一行，某一列 1）、打印文件的第一列(域) ...

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PHP7升级后Mysql报错的解决方案

刘洪波 2018-1-8 06:44

近期GoDaddy莫名其妙的自动升级了PHP版本（5.*7.*），导致Mysql数据库无法连接，这一错误的根源在于原有网页采用了mysql_connect，而PHP7将不再支持该模块，因此需要将网页中的mysql_connect更新为MySQLi或者PDO_MySQL，详情参考：http://php.net/manual/en/function.mysql-connect.php 解决办法：将原代码中的m ...

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基于RNA-seq的重复序列表达定量

刘洪波 2017-8-30 06:12

近期越来越多的研究关注重复序列在表观遗传调控中的作用，特别地，有些研究关注在特殊情况下重复序列表达转录本的情况，因此通过RNA-seq数据进行重复序列基因表达的需求越来越多。有两种方法可以实现这一目的，第一种利用bedtools对重复序列的read数进行count，第二种是基于cuffquant的重复序列表达定量。下面简单介绍两 ...

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