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如何计算战略坐标
崔雷 2010-4-16 11:04
:我们以一篇公开发表的论文中的矩阵作为例子,说明战略坐标的计算方法。数据来自于邱均平 等 关于共被引分析方法的再认识和再思考 情报学报 2008 27(1):69 74 数字是二者同被引次数,仅作为说明计算方法用,结果不具有实际意义。 此处对角线的数据是邱老师原文中按照共现最大次数+1计算的。 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|11039 次阅读|1 个评论
关于共现分析实际操作的通信
热度 3 崔雷 2010-4-13 09:18
对共现分析感兴趣的人越来越多,这是我在94年开始做这方面研究的时候没有预料到的,这确实是值得庆幸的一件事情,但是随之而来的会有很多实际问题,尤其是对于初学者,这个问题不妥善解决,恐怕会影响到该方法的普及,所以,我觉得有义务给大家多做些解释说明,让这个方法能够得以平稳健康的发展。 以下是我与一位湖 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|9757 次阅读|7 个评论 热度 3
书目共现分析软件下载网址
热度 5 崔雷 2010-3-16 16:40
已经把软件上传到 skydrive上去了,网址为: http://cid-3adcb3b569c0a509.skydrive.live.com/browse.aspx/BICOMB 对所有人公开,不需要登录到MSN。 共两个文件,选中其中一个,点击一下任一文件的图标,会转到下一个页面,两个文件的图标会移动到右方,然后选中其中的一个文件,点击左上角的下载,逐次 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|15552 次阅读|14 个评论 热度 5
BICOMB软件
热度 7 崔雷 2010-3-5 16:45
多年来,我们在文献计量学研究和文本挖掘研究中迫切感到需要一个分析工具。根据我们多年来摸索并积累下来的经验,我们开发了这个软件。其实也是经历了10多年,各种不同版本的更新,但是, 需要郑重说明的是,这个小东西很不完善,相当不完善 。只是由于很多人跟我打听国外一些免费软件的使用方法,总是觉得解释别人的东 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|21663 次阅读|10 个评论 热度 7
共现分析目前需要解决的问题以及主观上的经验
热度 3 崔雷 2010-2-20 11:35
共现分析越来越引起大家的兴趣,很多信息专业以外的研究人员也想利用这种方法分析自己学科领域的研究现状或者热点。因此,不断有人跟我探讨这个方法的具体使用问题,说实话,这个方法还在不断的完善之中,应用中有很多具体的问题还没有解决。所以,感觉应该把这个方法的一些弱点,或者说需要进一步完善的地方列举出来,同 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|6035 次阅读|4 个评论 热度 3
生物医学文献中新趋势的预测[摘译]
崔雷 2008-12-4 23:22
本文介绍一种利用基于文本数据来预测生物医学领域新出现的趋势的研究。其原理是 : 通过预测新增补到 MeSH 本体的主题词,来预测任意信息向真实知识的转化。本文也讨论了如何制备用于评价新趋势预测算法的数据集,该数据集是以 PubMed 摘要和相应的 MeSH 词作为基本材料的。结果表明对新趋势的早期预测 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|3119 次阅读|没有评论
发现论文作者之间的协作水平,改善转化研究[摘译]
崔雷 2008-11-20 06:14
摘要 转化研究就是将基础科学研究与患者治疗的改善结合起来的过程。从实质上讲, 这个过程需要广泛的技术和资源,一般不会在单个个体内发生。本研究调查了俄勒冈临床与转化研究所 (OCTRI) 发表论文的研究人员在协作上的特点,探索如何把不同专业的科学家结合起来促进转化性研究。 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|3020 次阅读|没有评论
通过矩阵分解从生物医学文献中抽取未知的基因关系(翻译文摘)
崔雷 2008-10-16 21:55
背景 构建出基于医学文献的基因相互作用网络是文本挖掘在生物信息学中最为重要的应用。从生物医学文献中抽取潜在的基因关系有助于建立生物医学假说,而假说可以通过实验进一步探索之。最近,基于奇异值分解(singular value decomposition)的潜在语义标引(latent semantic indexing)已经应用于基因检索上。然而, ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|4009 次阅读|没有评论

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