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利用聚类树聚合方法挖掘生物医学数据特征挖掘(摘要翻译)
2018-7-21 12:08
Mining Features for Biomedical Data using Clustering Tree Ensembles. Pliakos K , Vens C . J Biomed Inform. 2018 Jul 13 ; 可以供给 机器学习界利用的生物医学数据量增长非常迅速,随之带来一个问题:这些数据实际上能提供多少信息的?或者描述数据实例的特征有多大的区分度?一些生物医 ...
个人分类: 生物信息学|2208 次阅读|没有评论
通过web的生物医学文本处理工具:Whatizit
2016-7-20 13:24
动机:文本挖掘方法已经进入到为生物医学研究者提供有效服务的阶段。这些方法需要解决的首要问题是资源(比如受控词表 ) ,要处理的文献(比如在PubMed中已经有一千七 百万的文献),以及用户的需求(抽取事实的种方法 )等在 数量和体量的增长。这些需求刺激作者开发一个基于服务器的文献分析方法。Whatizit就是 ...
个人分类: 生物信息学|3683 次阅读|没有评论
转化生物信息学
2015-9-21 11:11
转化生物信息学是一个新兴领域,其目标是开发新的计算技术以促进传统的转化研究,手段是汇聚分子生物信息学、生物统计学、统计遗传学、和临床信息学。转化生物信息学比以前更加有力,并成为生物学发现与临床信息学之间的紧密衔接点。计算技术通过把构成用药、疾病、基因组的多维数据与临床和病理特征集成到一起发挥作用, ...
个人分类: 生物信息学|3968 次阅读|没有评论
译文:网络重新布局是基因重要性改变的重要机制
2015-1-28 13:40
Network rewiring is an important mechanism of gene essentiality change 网络重新布局是基因重要性改变的重要机制 基因重要性 改变对于生物进化十分重要。但是同源物种之间重要性如何变化却是不清楚的。我们根据网络演变的框架和基因组比较分析,研究酵母菌和小鼠 基因重要性 变化的 ...
个人分类: 生物信息学|2980 次阅读|没有评论
译文:一种针对代谢网络中的涌现特性的数学方法:局部耦合,超弧
2015-1-28 11:18
A mathematical approach to emergent properties of metabolic networks:Partial coupling relations,hyperarcs and fl ux ratios 一种针对代谢网络中的涌现特性的数学方法:局部耦合,超弧和流量参数。 系统生物学中的涌现特性只有在达到一定的复杂程度的时候才能产生。本研究介绍 ...
个人分类: 生物信息学|3077 次阅读|没有评论
也许有用
2011-10-4 07:48
F1000的Poster,不是正式发表的,多数是会议上的Poster,透露着最新的动态。 Meta-analysis of clinical prediction models Electronic medical record analysis using cloud computing Bioinformatics approaches for analyzing short-read illumina sequences of whole mycobacterium tuberculosis ...
个人分类: 生物信息学|2745 次阅读|没有评论
为什么Hubs(中心蛋白质)在蛋白质网络中易于成为必要蛋白质
2011-1-10 11:05
概述 网络由多个节点相互连接而成。大多数复杂网络都是无标度网络,这种网络中各个节点所拥有的边数呈幂律分布,就是说,在一个无标度网络中,有一小部分节点有较多的连接,我们称之为 hub (车轮轮辐的中心,或者网络中的集线器,本文中译作中心节点),而大量的节点则有较少的连接,我们称这些节点为非 hub 节 ...
个人分类: 生物信息学|9992 次阅读|1 个评论
蛋白质网络中的中心-致死法则【译文】
2011-1-7 13:40
传统上,人们对蛋白质的分析都是基于单个蛋白质的作用的,如把它当做细胞或者微生物的催化剂、信号分子或者构建模块,然而在当今的后基因组时代,我们对蛋白质的认识扩展到了将其作为蛋白质相互作用网络中的元素,在网络中,蛋白质在功能模块中具有相关的或者分子上的功能。这里,我们显示了酿酒酵母菌单基因缺失的表型后 ...
个人分类: 生物信息学|5860 次阅读|没有评论
基于本体的转化医学信息组织表达方法的探索
2009-11-13 08:52
【下面是我在中华医学会医学信息学学术年会上宣读的一篇论文的前言部分】 转化医学是指将基础研究人员和临床医生的研究成果整合起来,将其直接应用于病人身上,转化医学研究的目标就是探索如何跨越从实验室到病床的屏障。由于医疗实践的初衷就是尽可能多地利用知识和数据来治愈病人,所以转化医学不是什么新 ...
个人分类: 生物信息学|5016 次阅读|2 个评论
该打开窗子了
2008-11-12 11:52
就是为了赶上这个本专业最高水平的年会之一,我选定了后半年出国,可喜的是,今年的年会就在华盛顿开。可是临近的时候,还踌躇了,因为没有报名注册,怕去了被人撵出来。 还好,前来开会的学生告诉我,没有人把门,你去吧。我战战兢兢的和我的老板去了。 还好,大大方方地坐下,聆听思索,真是受益匪浅。10年前在奥 ...
个人分类: 生物信息学|3085 次阅读|1 个评论

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GMT+8, 2021-1-24 11:40

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