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VASP报错:forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
叶小球 2020-5-22 00:51
关注: VASP计算异常终止及解决办法 1、报错: Image PC Routine  ...
个人分类: 结构优化|801 次阅读|没有评论
VASP优化:NCORE、NPAR、KPAR设置
叶小球 2020-5-21 10:20
关注: 1) 并行计算参数设置 2) PBS文件解读 1、PBS文件解读 #!/bin/bash #PBS -N test_vasp #PBS -l select=1: ncpus=8 : mpiprocs=8 #PBS -l walltime=720:00:00 #PBS -q workq #PBS -j oe cd $PBS_O_WORKDIR VASP_EXEC=/data/apps/vasp-5.4.4/vasp NP=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` echo -n ...
个人分类: 结构优化|1162 次阅读|没有评论
晶界及位错模型构建
叶小球 2020-4-22 09:27
关注: 晶界及位错模型构建 晶界构建方法与观点: 1) 在MS里可以切出表面,然后对接成晶界。 然而,就简单的周期性晶界模型,比如利用重合位置点阵CLS模型来建晶界,如文献Sr 偏析Al晶界结构的第一性原理计算,刘利花,张颖,吕广宏,物理学报,2008,(57)4428-4433“在建模时怎么将已知晶体旋转相应 ...
个人分类: 表面科学|890 次阅读|没有评论
VASP过渡态搜索:脚踏实地
叶小球 2020-4-4 00:24
关注: 1) INCAR解读 2) NEB原理及使用方法: http://sobereva.com/44 3) 新手入门 一些认识摘录: NEB 是 chain-of-states 搜索方法的一种,经过长时间的发展形成现在的准确性好,稳定性好的 CINEB 方法。做法就是在反应物到产物之间插入一系列结构,共插入 P-1 个,反应物编号为 0,产编号物为 P。 不同的是 ...
个人分类: 小技巧|1638 次阅读|1 个评论
DFT+U 再认识:优化过程中参数参看,如是否磁性发生变化(总磁矩)
叶小球 2020-3-13 11:51
关注: 1) DFT+U参数设置 2) DFT+U焓值变化曲折问题 3) DFT+U优化过程中参数参看,如是否磁性发生变化(总磁矩) Thanks to Ruizhi 参数设置 PREC = Accurate ENCUT = 400.0 EDIFF = 1E-6 EDIFFG = -2E-3 #SYMPREC=1e-3 IBRION = 2 POTIM = 0.05 ISIF = 3 NSW = 100 #LSDA-plus-U ISPIN=2 LDAU ...
个人分类: 结构优化|928 次阅读|4 个评论
结构预测软件使用过程中的一些细节
叶小球 2020-2-17 15:28
关注: 1) input.dat设置细节 2) 读取能量数据的一些细节 (1) input.dat cat input.dat ################################ The Basic Parameters of CALYPSO ################################ # A string of one or several words contain a descriptive name of the system (max. ...
个人分类: 结构预测|725 次阅读|2 个评论
学而时习之:热处理
叶小球 2019-12-14 15:21
关注: 1) 马氏体、奥氏体 2) 四把火:正火与回火 “马氏体和奥氏体都是钢在热处理过程中的一种组织形态。 马氏体和奥氏体的不同在于, 马氏体是体心正方结构 , 奥氏体是面心立方结构 。 奥氏体向马氏体转变仅需很少的能量,因为这种转变是 无扩散位移型的 ,仅仅是迅速和微小的原子重排。 ...
个人分类: 科海泛谈|845 次阅读|没有评论
arxiv.org使用指南
叶小球 2019-9-15 23:03
关注文章投稿 1) 如何抢先发布研究成果 2) 如何整理研究成果,使其易于被期刊接收 3) 努力的境界:信手拈来,皆是文章 arxiv.org是全球最大的预印本系统,由美国国家科学基金会和美国能源部资助,在美国洛斯阿拉莫斯(Los arXiv.org是一个收录科学文献预印本的在线数据库,目前包含 ...
个人分类: 论文投稿|4607 次阅读|没有评论
朝花夕拾:Jade-XRD 氢化腐蚀
叶小球 2019-8-1 11:07
关注: 1、Jade导入txt数据 2、晶格常数计算 3、氢进入晶格后,晶格常数的变化 Jade导入txt数据 https://www.jinchutou.com/p-91573760.html txt文件格式 【导入后,角度发生偏移,待解决】 Red Paint Pigment Mixture 20.0 372 20.02 403 20.04 3 ...
个人分类: 小技巧|999 次阅读|没有评论
关于origin曲线平滑处理 lowess
叶小球 2019-6-6 22:52
关注: 1) origin数据积分、寻峰 2) origin数据平滑处理 https://www.originlab.com/origin#Peak_Analysis https://www.originlab.com/doc/Origin-Help/Smooth-Algorithm The Lowess and Loess method Lowess and Loess are abbreviations for locally weigh ...
个人分类: 小技巧|6041 次阅读|1 个评论

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GMT+8, 2020-8-10 14:33

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