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AMBER基础教程B3 色氨酸肽笼的全原子结构预测和折叠模拟 2018-05-17
  Ross Walker  原始文档 2018-05-16 19:56:42 翻译: 张少波; 校对: 李继存 初始线型结构 色氨酸肽笼的NMR结构(1L2Y) 本教程旨在 ...
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xpm文件处理脚本 2018-05-10
  2018-05-09 17:57:54 在输出二维矩阵数据时, GROMACS经常会使用xpm格式的文件. 虽然这种格式的文件可以使用 xpm2ps 转换为ps图片格式之后再查看, ...
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AMBER高级教程A17: 伞形采样计算平均力势PMF 2018-04-27
  Ross Walker & Thomas Steinbrecher,  原始文档 2018-04-26 16:53:52 翻译: 刘杰 在本教程, 我们将学习怎样结合Alan Grossfiled的 ...
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GROMACS自由能计算中软核势的使用 2018-04-26
  2018-04-25 16:24:25 The following is my notes about the  GROMACS Soft-Core Potential for Free Energy Calculation Theory The soft ...
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自动下载喜马拉雅音频文件 2018-04-21
  2018-04-21 07:15:53 喜马拉雅网站上有一些有价值的音频可以下载, 但手动下载的话很是麻烦, 所以就看了一下能不能自动下载. 鉴于每个音频的网址好 ...
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Amber教程:涉及非标准残基的模拟 2018-04-19
  Vlad  原始文档 2018-04-19 07:22:01 翻译: 许楠(浙江大学) 目标 本教程这一部分介绍创建 sander 输入文件所需要的AMBER程序/工具,&nbs ...
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AMBER高级教程A12:使用Amber11处理聚脯氨酸 2018-04-18
  V. Babin and C. Sagui, April 27, 2010  原始文档 2018-04-18 07:21:03 翻译: 吴伟(东华大学) 摘要 本文介绍了几种利用sander程序(Amb ...
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实时改变GROMACS拓扑的分段模拟方法 2018-04-10
  2018-04-09 20:30:24 问 : 有没有办法在GROMACS运行中根据一定的条件改变体系的拓扑文件? 没有, 除非去修改GROMACS的源代码. 目前的大多数MD程 ...
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有两件事物我愈是思考愈是神奇
心中也愈充满敬畏
这就是有限的生命与无限的宇宙

Two things fill the mind with ever-increasing wonder and reverence, the more often and the more intensely one reflects on them: the finite lives and the infinite cosmos.
----J C L
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