做小动物活体荧光成像的都知道，去除动物本身的自发荧光很重要，从混合波谱中提取出探针波谱和自发荧光波谱是实验结果成败的关键。但是自发荧光不等于没用，自发荧光波谱及强弱的变化和实验动物的状态存在着某种相关关系。这种相关关系应经被应用到了临床领域，比如说眼底疾病与眼底自发荧光检查，胃镜等各种腔镜手术中粘膜炎症与自反荧光的关系，口腔疾病与口腔内部组织自发荧光的联系，另外还有最具探索价值的是人体皮肤自发荧光与体内晚期糖基化终末产物（AGMs）的关系。目前AGEs的研究很热，很多临床试验在探讨其与糖尿、终末期肾病、系统性多发硬化、炎症以及风湿性疾病之间的关系，通过检测皮肤自发荧光来间接反映AGEs含量应经在临床上广泛应用，但是针对AGEs和自发荧光的动物实验还寥寥。

    探讨自发荧光与疾病关系的动物实验有更多的优势，比如自发糖尿病或诱导糖尿病的动物模型可以被长期观察其皮肤自发荧光，通过自发荧光波谱或强度的变化来观察糖尿病的进程，比如应用小动物活体荧光成像仪器不仅可以得到某个激发/发射波长部位自发荧光的强度，而且可以获得不同激发光条件下自发荧光的光谱图，从而更加容易找到其中的差异，又比如动物实验可以让我们观察某个单独脏器的自发荧光，也许不同诱导方式产生的肝脏炎症模型自发荧光都会存在差异。通过自发荧光的检测来研究疾病的发生发展有可能是一个新的领域。