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PAUP 4已注册版,系统发育分析老牌经典软件
热度 1 高芳銮 2013-7-31 15:04
PAUP4 注册版,全功能,支持 Win7,安装后运行主程序即可。 特别感谢KuNgBiM兄帮忙解决程序过期问题! 欢迎加入生物软件交流群:323809849,交流生物软件问题! Enjoy!!更多生物软件,请访问我的网盘: http://raindy.ys168.com Raindy 2013 福州
个人分类: 软件教程|9342 次阅读|1 个评论 热度 1
MAFFT多重序列比对图解教程(By Raindy)
热度 3 高芳銮 2013-7-7 15:21
【絮语】   一提到多重序列比对,很多人禁不住就想到ClustalW(Clustalx为ClustalW的GUI版),其实有一款多重序列比对软件-MAFFT,不论从比对速度(MuscleMAFFTClustalWT-Coffee),还是比对准确性(MAFFTMuscleT-CoffeeClustalW)来说,其相比于ClustalW(或ClustalX)有过之而无不及,所以 ...
个人分类: 软件教程|56699 次阅读|4 个评论 热度 3
参考文献利器-Endnote X7 出来了,推荐更新
热度 10 高芳銮 2013-6-16 16:12
  Endnote, 不再多言,参考文献利器,科研必备。前几天就出来了,试用了几天,虽然对PDF导入功能改善不太明显,但X6等版本在插入文献后编辑文档响应慢的问题得以明显改善,推荐更新!   官方下载 : http://endnote.com/x7/ENX7Inst.exe   破解补丁 :请移步到我的网盘下载: http:/ ...
个人分类: 软件教程|23492 次阅读|18 个评论 热度 10
BioWord, a powerful biological sequence editor inside Word
高芳銮 2013-6-14 21:02
BioWord,一个Word插件,可用于 核苷酸序列和氨基酸序列 的常规操作,上图先睹为快,推荐使用! 官方网站: http://compbio.umbc.edu/3655/ BioWord is a powerful biological sequence editor operating in the most convenient of places: inside your usual word-processor (M ...
个人分类: 软件教程|6486 次阅读|没有评论
核苷酸替代模型的选择
高芳銮 2013-5-27 09:42
   【絮语】 在进行系统发育分析过程中,建树序列的进化模型选择是至关重要的一步,尤其对进化模型敏感的ML法和BI法,更是重中之重。对于一些初学者而言,经常使用默认参数而忽略了这一关键步骤,从而导致建树结果的不理想。    【必备工具】 PAUP、MrMTgui、ModelTest (or MrModelTest) ,相关工具可以网上 ...
个人分类: 软件教程|12981 次阅读|没有评论
【持续更新】系统发育分析 FAQ
热度 6 高芳銮 2013-5-24 11:49
  【絮语】 系统发育分析是研究物种进化和系统分类的一种常见方法, 构建系统发育树也就是我们通常所说的建树,经常有人让帮忙建树,虽非系统发育专业人士, 但在科研工作者经常与之打交道,分享一些积累的建树经验,权当抛砖引玉,希望对新手有用,特此整理一些常见问题如下:    1.什么序列适合建树?(建树的 ...
个人分类: 软件教程|19030 次阅读|9 个评论 热度 6
多重比对着色软件包 TEXshade 图解教程(一)
热度 5 高芳銮 2013-5-21 17:13
【絮语】   TEXshade 是 Latex 的一个宏包,可以对 MSF或 ALN 格式的多重比对文件以不同的方式进行着色美化,并可以对重要的位置和区域作出标记,用 TEXshade软件包能做出来的多重比对可视化效果,常常让有一种耳目一新的感觉,当然也是投高IF期刊所必须的。   如果有 LaTeX 基础,TEXshade 可能只是小菜一碟 ...
个人分类: 软件教程|15405 次阅读|9 个评论 热度 5
常见生物软件使用技巧汇集(持续更新)
热度 6 高芳銮 2013-5-20 09:35
【絮语】和生物学软件打交道,难免会遇到各式各样的问题,如何针对不同软件的特点,择优选用以事半功倍解决问题?鉴于此,特整理此帖,希望对新手有用,持续更新,敬请关注。 Q1.怎么查找序列保守区? A1:很多人查找序列保守区,一般通过序列多重比对后,肉眼判断序列保守区,但此法难免太主观,不具重复性,且 ...
个人分类: 软件教程|25359 次阅读|10 个评论 热度 6

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