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#笔记#氨基酸残基质子化形式的判断（pKa预测）: 王少许 2021-1-20 20:59; 1、判断aa残基的质子化形式过程简述： a、计算pka 可以使用propka 或者H++等在线网站，在输出文件中，会列出相应残疾的pKa预测值，以及氨基酸类型； b、可视化检查。用VMD、PyMol等打开蛋白质的三维构象，看HIS侧链的ND1和NE2哪个可能和其它残基形成氢键，能形成氢键的，且H在HIS上更为合适的，就认定该N原子是质 ...; 13055 次阅读|没有评论

#笔记#pymol: 王少许 2021-1-19 12:58; User interface （UI）：Basic Settings # File- New Pymol Windows Reinitialize # Display – sequence mode – residues names Quality 整体外观的修改 Color ...; 个人分类: 学习笔记|3388 次阅读|没有评论

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