科学网

 找回密码
  注册
搜索
热搜: 科学 论文
搜索
分享 Nature Method:HUMAnN2实现宏基因组和宏转录组种水平功能组成分析
刘永鑫 2018-11-2 15:30
HUMAnN2实现宏基因组和宏转录组种水平功能组成分析 Species-level functional profiling of metagenomes and metatranscriptomes Nature Methods, , Article, 2018-10-30 DOI: http://dx.doi.org/10.1038/s41592-018-0176-y 第一作者: Eric A. Franzosa, Lauren J. McIver 通讯作者:Curtis Huttenhow ...
个人分类: 读文献|767 次阅读|没有评论
分享 Nature综述:人类微生物培养以及培养组学(Culturing the human microbiota and cu
刘永鑫 2018-10-23 15:51
本文译者Wenzday,校稿宏基因组 人类微生物培养以及培养组学 Culturing the human microbiota and culturomics Jean- Christophe Lagier1, Grégory Dubourg1, Matthieu Million1, Frédéric Cadoret2, Melhem Bilen1,3, Florence Fenollar4, Anthony Levasseur1, Jean- Marc Rolain1, Pierre-Edouard Fournier 4 and ...
个人分类: 读文献|2780 次阅读|没有评论
分享 Nature :全球表层土壤中微生物组的结构和功能
刘永鑫 2018-10-19 08:35
Structure and function of the global topsoil microbiome 全球表层土微生物组群落结构和功能 Mohammad Bahram , Falk Hildebrand, Sofia K. Forslund, Jennifer L. Anderson, Nadejda A. Soudzilovskaia, Peter M. Bodegom, Johan Bengtsson-Palme, Sten Anslan, Luis Pedro Coelho, Helery Harend, Jaime Huerta-C ...
个人分类: 读文献|2700 次阅读|没有评论
分享 Microbiome:宏基因组分箱流程MetaWRAP简介
刘永鑫 2018-10-13 18:23
MetaWRAP—a flexible pipeline for genome-resolved metagenomic data analysis 题目:MetaWRAP——灵活的宏基因组数据挖掘单菌基因组分析流程 作者:Gherman V. Uritskiy, Jocelyne DiRuggiero and James Taylor 单位:约翰斯·霍普金斯大学,生物系 文章于2018年3月6日发布于bioRxiv上 https://www.biorxiv.org ...
个人分类: 读文献|774 次阅读|没有评论
分享 npjsba-2018-用肠道微生物模型指导个性化膳食缓解局部性肠炎
刘永鑫 2018-10-3 11:34
本文由同济大学赵晗编译,宏基因组公众号编辑。 用肠道微生物模型指导个性化膳食缓解局部性肠炎 npj Systems Biology and Applications-2018 基于宏基因组数据个性化计算分析微生物组:预测克罗恩症的膳食补充物 From metagenomic data to personalized in silico microbiotas: predicting dietary supplements ...
个人分类: 读文献|636 次阅读|没有评论
分享 Gut-2018-早期肝癌肠道生物标志物鉴定
刘永鑫 2018-9-7 16:20
今年6月,基于早期肝癌患者肠道标记物开发的文章正式发表于Gut杂,影响因子17分。 两位院士坐镇,三位通讯加起来近200岁,100多年科研经验。郑树森团队已成功施行肝移植2300余例,良性肝病受者1年生存率达95.2%,符合其2006年提出的肝癌肝移植“杭州标准”的肝癌病人5年存活率达到72.5%;在国际著名学术期 ...
个人分类: 读文献|1243 次阅读|没有评论
分享 PNAS-2018-多年多点5千样本鉴定玉米根际可遗传微生物
刘永鑫 2018-8-13 17:52
由Ruth E. Ley通讯,Edward S. Buckler和Jeffery L. Dangl参与,编辑则为本领域第一大牛Jeffery I. Gordon 本文的结果已经相关文章讲解的非常详细了,详见下文: PNAS-2018-玉米根际的大规模田间重复研究确定可遗传的微生物 今天我们再从方法学角度带大家看一下此文。 摘要 在重要农作物中,不同基因型的 ...
个人分类: 读文献|1379 次阅读|没有评论
分享 Cell综述:人类肠道菌群-从关联到调控
热度 3 刘永鑫 2018-8-11 10:05
今年3月Cell推出了微生物组专刊,详见下方链接。 Cell:22篇微生物文章为微生物组打Call 其中Peer Bork一篇关于人类肠道微生物组关联分析的综述写的非常系统,值得广大同行精读学习。 全文15000余字,我将阅读笔记分享给大家,欢迎广大同行留言讨论和批评指正。 人类肠道微生物组:从关联到调控 Thomas S.B. ...
个人分类: 读文献|10457 次阅读|3 个评论 热度 3
分享 PNAS-2018-玉米根际的大规模田间重复研究确定可遗传的微生物
刘永鑫 2018-8-7 19:18
本文“植物微生物组”公众号原创,ID: plantmicrobiome 作者:张娜 原文链接: PNAS-2018-玉米根际的大规模田间重复研究确定可遗传的微生物 大家上午好,占用大家30分钟的时间,跟大家分享一下这篇文章。这篇文章的题目是:玉米根际的大规模田间重复研究确定可遗传的微生物 首先介绍一下本篇文章的通讯作者: R ...
个人分类: 读文献|927 次阅读|没有评论
分享 PNAS-2018-病原菌在植物免疫下的转录组
刘永鑫 2018-7-10 13:03
之前的研究一直关注的是宿主(植物)的转录组在病原菌侵染条件下有什么变化,而很少研究病原菌在植物免疫刺激下的变化。主要还是受方法的限制,因为材料中绝大多数是植物组织的转录本,极难获取足够量的病原菌转录本。 本文介绍了一种新方法,可以去除植物组织,特异富集病原菌的转录本,从而获得植物体内病原菌转录组。本 ...
个人分类: 读文献|1088 次阅读|没有评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备14006957 )

GMT+8, 2019-7-21 10:33

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部