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热搜: 科学 论文
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分享 NBT:宏基因组中设计全面可扩展探针捕获序列多样性
刘永鑫 2019-2-18 21:28
宏基因组中设计全面可扩展探针用于捕获序列多样性 Capturing sequence diversity in metagenomes with comprehensive and scalable probe design Nature Biotechnology, 10.1038/s41587-018-0006-x 原文链接: https://www.nature.com/articles/s41587-018-0006-x 第一作者:Hayden C Metsky, Katherine ...
个人分类: 读文献|251 次阅读|没有评论
分享 NRM: 地球上细菌和古菌的生物膜丰度
刘永鑫 2019-2-18 21:07
NRM: 地球上细菌和古菌的生物膜丰度 Bacteria and archaea on Earth and their abundance in biofilms 分析类综述, 2019-02-13 Nature Reviews Microbiology, 10.1038/s41579-019-0158-9 第一作者 Hans-Curt Flemming 通讯作者 Hans-Curt Flemming, Stefan Wuertz 热心肠导读 生物膜是微生物 ...
个人分类: 读文献|423 次阅读|没有评论
分享 TM:宿主-细菌界面的MicroRNA:宿主防御或细菌攻击
刘永鑫 2019-2-18 20:38
TM:宿主-细菌界面的MicroRNAs:宿主防御或细菌攻击 MicroRNAs at the Host–Bacteria Interface: Host Defense or Bacterial Offense 日报 MicroRNA(miRNA或微RNA)是一类小的非编码RNA,是基因表达的转录后调节因子; 微RNA的变化可以反映宿主对感染的反应,也可以是细菌病原体为破坏宿主的关键功能而设计的策略; ...
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分享 Fertility of Soils:根系C P计量比影响水稻残根周际酶活的时空动态分布特征
刘永鑫 2019-2-17 22:40
根系C/P计量比影响水稻残根周际酶活的时空动态分布特征 C/P stoichiometry of dying rice root defines the spatial distribution and dynamics of enzyme activities in root-detritusphere Biology and Fertility of Soils , 2019, doi.org/10.1007/s00374-019-01345-y Xiaomeng Wei, Bahar S. Razavi, Yajun Hu, ...
个人分类: 读文献|558 次阅读|没有评论
分享 NBT:超高速细菌基因组检索技术
刘永鑫 2019-2-17 07:44
超高速搜索现存细菌和病毒基因组 Ultrafast search of all deposited bacterial and viral genomic data Nature Biotechnology, 10.1038/s41587-018-0010-1 原文链接: https://www.nature.com/articles/s41587-018-0010-1 第一作者:Phelim Bradley 通讯作者:Zamin Iqbal 其它作者:Henk C den Bakker, ...
个人分类: 宏基因组|424 次阅读|没有评论
分享 PNAS:亚马逊雨林向农业的转变导致土壤细菌群落的生物均质化
刘永鑫 2019-2-16 17:16
亚马逊雨林向农业的转变导致土壤细菌群落的生物均质化 Conversion of the Amazon rainforest to agriculture results in biotic homogenization of soil bacterial communities 译者:刘海燕 石河子大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 杂志:PNAS 第一作者:Jorge L. M. Rodriguesa 通讯作者:Brendan J. M. ...
个人分类: 读文献|877 次阅读|没有评论
分享 Nature:肠道内微生物合作方式的探究
刘永鑫 2019-2-13 22:31
肠道内微生物合作方式的探究 撰文:冯雨彤 浙江中医药大学 责编:刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所 写在前面 2016年4月25日在Nature杂志发表了一则文章,展示了肠道菌群合作的内部关系。此文采用实验验证了细菌-人类肠道中主要革兰氏阴性菌内部进化的协同作用,并以它为例揭示了合作表型在哺乳动物肠道 ...
个人分类: 读文献|921 次阅读|没有评论
分享 Microbiome:应用多维宏组学方法协同揭示复杂细菌群落对目标底物代谢的菌间相互关系
刘永鑫 2019-2-12 21:54
Microbiome: 应用多维宏组学方法协同揭示复杂细菌群落对目标底物代谢的菌间相互关系 香港大学张彤教授团队与北京大学余珂博士研究团队,以生物降解菌群为研究模型,运用多维宏组学方法(宏基因组、宏转录组及目标性代谢组学联合)解析混合微生物群落内细菌间协同代谢关系 。研究成果以“An integrated meta-omics ap ...
个人分类: 新闻|838 次阅读|没有评论
分享 使用ComplexHeatmap包绘制个性化热图
刘永鑫 2019-2-11 23:22
使用ComplexHeatmap包绘制个性化热图 作者:刘梦瑶 诺禾致源 微生物信息 审稿:刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所 ComplexHeatmap包由顾祖光博士创建,是一个非常全面的绘制热图的R包,可以利用它来绘制许多文献中的美图,例如下图展示的16S文献分析中的热图。这里主要介绍一下如何用这个R包来绘制类似的个性化 ...
个人分类: R|1584 次阅读|没有评论
分享 [转载]使用ComplexHeatmap包绘制个性化热图
刘永鑫 2019-2-11 23:21
使用ComplexHeatmap包绘制个性化热图 作者:赵维 诺禾致源 微生物信息 审稿:刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所 ComplexHeatmap包由顾祖光博士创建,是一个非常全面的绘制热图的R包,可以利用它来绘制许多文献中的美图,例如下图展示的16S文献分析中的热图。这里主要介绍一下如何用这个R包来绘制类似的个性 ...
个人分类: R|494 次阅读|没有评论

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