QIIME 2用户文档. 5粪菌移植分析练习Fecal microbiota transplant (FMT)(2017

刘永鑫 2019-8-31 21:56

前情提要 Nature Biotechnology：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析MovingPicture QIIME 2用户文档. 5粪菌移植分析练习 Fecal microbiota transplant (FMT) study ...

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Linux Shell Tips小技巧

刘永鑫 2019-8-29 20:08

sed 指定行 sed -n '5,10{/pattern/p}' file 删除文本 # 删除第一行 sed '1d' temp.txt # 删除1-4行 sed '1,4d' temp.txt 替换文本 file文件中的第三行中的aaa替换为fff sed -i '3s/aaa/fff/' file 文件中找出包含xxx的行，并将其中的aaa替换为fff sed -i '/x ...

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mSystems：干旱对土壤微生物组的影响

刘永鑫 2019-8-29 10:01

干旱对土壤微生物组的影响 增加干旱对干旱土壤微生物组的显著影响 Significant Impacts of Increasing Aridity on the Arid Soil Microbiome Microbiome, 2017-05-30 Articles DOI: https://doi.org/10.1128/mSystems.00195-16 第一作者：Julia W. Neilson a , Katy Califf b 通讯作者：Raina M. ...

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Microbiome：粪菌移植改善自闭症

刘永鑫 2019-8-29 09:24

粪菌移植改善自闭症 微生物转移疗法改变肠道生态系统，改善肠胃和孤独症症状：一项开放性研究 Microbiota Transfer Therapy alters gut ecosystem and improves gastrointestinal and autism symptoms: an open-label study Microbiome, 2017-01-23 Articles DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-016 ...

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QIIME 2用户文档. 4人体微生物组分析Moving Pictures(2019.7)

刘永鑫 2019-8-26 23:56

前情提要 Nature Biotechnology：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced QIIME 2用户文档. 4人体各部位微生物组 “Moving Pictures” tutorial https://docs.qiime2.org/2019.7/tutorials/movi ...

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NBT封面：纳米孔基因组测序快速临床诊断细菌性下呼吸道感染

刘永鑫 2019-8-23 23:35

Nanopore宏基因组测序快速临床诊断细菌性下呼吸道感染 Nanopore metagenomics enables rapid clinical diagnosis of bacterial lower respiratory infection 译者：文涛 南京农业的大学 责编：刘永鑫 中科院遗传发育所 Nature Biotechnology 2019-06-24 Articles DOI: https://doi.org/10.10 ...

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Cell子刊：人类微生物组参考基因集中的单体基因

刘永鑫 2019-8-22 13:09

人类肠道和口腔微生物组中遗传基因全貌 The Landscape of Genetic Content in the Gut and Oral Human Microbiome Cell Host and Microbe 2019-08-14 Resource DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.07.008 第一作者：Braden T. Tierney 1,2,3,4 通讯作者：Chirag J. Patel 4,* , ...

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2019国自然微生物中标4个亿

刘永鑫 2019-8-21 01:36

2019国自然微生物中标4个亿 上周公布国自然2019中标情况。让我们了解一下微生物领域的资助情况。 在科学网基金频道( http://fund.sciencenet.cn/)检索2019年国家自然科学基金中标情况。 项目名称包含微生物共检索到380项，2.157亿；生命科学部-微生物学科共包括404项，2.1594亿；两者共有20项，2503万。去冗余累计 微 ...

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QIIME 2用户文档. 3老司机上路指南(2019.7)

刘永鑫 2019-8-17 11:20

前情提要 Nature Biotechnology：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 老司机上路指南 QIIME 2 for Experienced Microbiome Researchers https://docs.qiime2.org/2019.7/tutorials/qiime2-for-experienced-microbiome- ...

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