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编者序:初衷、计划、要求、优势、目标和展望
刘永鑫 2020-6-5 22:19
020编者序 写在前面 2020年4月底,宏基因组公众号编辑部内部启动了《微生物组数据分析和可视化实战》专项计划(又名《宏基因组学百科全书》),该项目是对2017年以来宏基因组公众号发布的上千篇原创文章进行系统的总结和更新,希望在接下来一年以时间里,初步形成一套对本领域新人入门的教材,同时是专业同行查找相关资源 ...
个人分类: 读文献|137 次阅读|没有评论
众筹编写《微生物组数据分析与可视化实战》——成为宏基因组学百科全书的创始人
刘永鑫 2020-6-3 23:27
众筹编写《微生物组数据分析与可视化实战》——成为宏基因组学百科全书的创始人 高通量测序的发展极大地推动了微生物组/宏基因组领域的发展。微生物组的数据分析和解读需要微生物学、生物信息学、统计学、Shell和R语言、宏基因组学等多学科的知识,无论是中国还是世界范围内仍缺少系统的学习教材。宏基因组公众号成立 ...
个人分类: 经验|166 次阅读|没有评论
Microbiome:中外合作揭示微生物群落降解复杂微生物聚合物的酶(视频导读)
刘永鑫 2020-6-3 00:32
培养及非培养宏基因组技术揭示微生物群落降解复杂微生物聚合物的遗传和酶活潜力 Cultivation-independent and cultivation-dependent metagenomes reveal genetic and enzymatic potential of microbial community involved in the degradation of a complex microbial polymer Microbiome 【 Impact Factor 10 ...
个人分类: 作者解读|185 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 32如何写方法和引用Citing(2020.2)
刘永鑫 2020-5-26 19:19
前情提要 NBT:QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT Microbiome:粪菌移植改善自 ...
个人分类: QIIME2|335 次阅读|没有评论
JoVE微生物组专刊征稿,写方法拍视频教程发SCI(宏基因组公众号专属福利)
刘永鑫 2020-5-25 23:07
JoVE 视频实验杂志 官网: https://www.jove.com/ 包括上万个实验和分析方法视频,还有几十个领域的数百个专业视频教程资源。 这个杂志被SCI收录了吗?必须的。杂志在Web of Science中JCR信息如下: 2年影响因子 1.1,5年影响因子1.6。杂志和视频需要订阅才能访问,一定成度限制了传播和引用,但今年开始允 ...
个人分类: 新闻|106 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 31名词Glossary(2020.2)
刘永鑫 2020-5-25 20:18
前情提要 NBT:QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT Microbiome:粪菌移植改善自 ...
个人分类: QIIME2|90 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 30补充资源SupplementaryResources(2020.2)
刘永鑫 2020-5-24 16:20
前情提要 NBT:QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT Microbiome:粪菌移植改善自 ...
个人分类: QIIME2|203 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 29参考数据库DataResources(2020.2)
刘永鑫 2020-5-22 10:11
前情提要 NBT:QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT Microbiome:粪菌移植改善自 ...
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QIIME 2教程. 28社区Community(2020.2)
刘永鑫 2020-5-21 20:42
前情提要 NBT:QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT Microbiome:粪菌移植改善自 ...
个人分类: QIIME2|153 次阅读|没有评论
ISME:中科院动物所张知彬组揭示肠道微生物介导了降雨变化对布氏田鼠种群的上行效应
刘永鑫 2020-5-21 19:29
肠道微生物介导了降雨变化对布氏田鼠种群的上行效应 Host-microbiota interaction helps to explain the bottom-up effects of climate change on a small rodent species Article,2020-04-20 The ISME Journal, DOI: https://doi.org/10.1038/s41396-020-0646-y 原文链接: https://www.nature.com/arti ...
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