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分享 QIIME 2用户文档. 18使用q2-vsearch聚类OTUs(2018.11)
刘永鑫 2019-1-30 08:54
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
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分享 QIIME 2用户文档. 17序列双端合并read-joining(2018.11)
刘永鑫 2019-1-29 09:32
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
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分享 QIIME 2用户文档. 16鉴定和过滤嵌合体序列q2-vsearch(2018.11)
刘永鑫 2019-1-28 14:20
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
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分享 QIIME 2用户文档. 15进行纵向和成对样本比较q2-longitudinal(2018.11)
刘永鑫 2019-1-27 20:10
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
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分享 宏基因组QIIME2专题讨论群
刘永鑫 2019-1-26 12:46
写在前面 宏基因组公众号负责QIIME 2 官方中文文档的更新。目前已经有更新了14章,近8万字(详见下方文章列表链接)。 鉴于QIIME 2的整体架构和使用方法与QIIME存在较大不同、QIIME 2仍存在一些不足,同时用户也积累了较多共性问题。 现成立QIIME 2中文微信讨论群,方便真正使用者间的经验交流。 扫描以下二维码。 备注 ...
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分享 QIIME 2用户文档. 14机器学习预测样品元数据分类和回归q2-sample-classifier(2018.11)
刘永鑫 2019-1-24 18:25
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
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分享 QIIME 2用户文档. 13数据评估和质控Evaluating and controlling(2018.11)
刘永鑫 2019-1-7 00:17
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing ...
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分享 QIIME 2用户文档. 12训练特征分类器Training feature classifiers(2018.11)
刘永鑫 2019-1-6 10:54
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing ...
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分享 QIIME 2用户文档. 11数据筛选Filtering data(2018.11)
刘永鑫 2019-1-5 14:19
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing ...
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分享 QIIME 2用户文档. 10元数据Metadata(2018.11)
刘永鑫 2019-1-4 21:22
前情提要 文章导读:QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 4人体各部位微生物组分析 5粪菌移植分析练习 5粪菌移植分析练习 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入 9数据导出 QI ...
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