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  • 中国科学院,遗传与发育生物学研究所,工程师

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tianxinzhilang 2019-2-27 14:40
刘老师,您好。我最近在学习CoNet网络分析作图,按照您写的流程。前两步(初建和置换)过程很顺利,没有问题。但是进行到bootstrap步骤时,不管怎么更换选项和分析方法,出来的结果始终显示nodes和edges为零。不知道是因为选项的问题还是数据本身导致的问题。还望老师您指点迷津,谢谢!
xugexi 2019-1-25 10:09
刘博士,您好。我在尝试进行扩增子分析流程,按照您在宏基因组上的分享进行: https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMjA4Njc1MA==&mid=2247483885&idx=1&sn=fb3bf1551621e49d8733104ec91223ae&scene=21#wechat_redirect ,但是在网盘下载您提供的测序数据、实验设计与课程分析生成的中间文件( http://pan.baidu.com/s/1hs1PXcw )时发现已经被删除了,能否重新提供或发我邮箱xugexi@163.com,谢谢,祝好! ...
xjlan 2018-7-24 22:00
刘老师您好,刚刚接触ggpubr这个R包,您关于ggpubr的博文我逐条学习,当进行到图4(增加不同组间的p-value值,可以自定义需要标注的组间比较)时,一直报错,提示内容如下: Don\'t know how to automatically pick scale for object of type quosure/formula. Defaulting to continuous. Don\'t know how to automatically pick scale for object of type quosure/formula. Defaulting to continuous. Error in validDetails.text(x) : \'pairlist\' object cannot be coerced to type \'double\') R命令都是按照博文内容复制, ... ...
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GraPhlAn:最美进化树或层级分类树学习笔记 2019-03-21
Graphlan可视化进化树 撰文:文涛 南京农业的大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 GraPhlAn简介 总体来讲,Graphlan是一个可视化进化树和基于分类等级 ...
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MER:高通量测序应用于病原体和害虫诊断——综述与实用性建议 2019-03-20
高通量测序应用于病原体和害虫诊断——综述与实用性建议 High‐throughput identification and diagnostics of pathogens and pests: Overview and pract ...
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Microbiome:根系分泌物驱动土壤记忆抵御植物病原菌(作者解读) 2019-03-19
根系分泌物驱动土壤记忆抵御植物叶际病原菌 Root exudates drive the soil-borne legacy of aboveground pathogen infection 撰文:文涛 南京农业大 ...
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德国耶拿大学植物微生物组实验室急招博士生项目,申请截止19年3月20日 2019-03-18
招聘信息原文: https://sites.google.com/view/microbiosis/now-hiring (本文中网址均为Google子网页,访问可能需要科学上网) Doctoral Researcher Po ...
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TEE综述:植物—土壤反馈(PSF):自然和农业科学间的桥梁 2019-03-12
2018年《生态和进化前沿》综述( https://doi.org/10.1016/j.tree.2017.11.005 ) Trends in Ecology & Evolution (IF = 15.938) 植物—土壤反馈(PSF) ...
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Briefings in Bioinformatics:微生物基因组学和功能基因组学相关软件和数据库的研究进展 2019-03-11
微生物基因组学和功能基因组学相关软件和数据库的研究进展 原标题:Recent developments of software and database in microbial genomics and functiona ...
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Microbiome:微生物组名词定义 2019-03-10
微生物组相关词汇定义 The vocabulary of microbiome research: a proposal Microbiome, , 30 July 2015 https://doi.org/10.1186/s40168-015-00 ...
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Microbiome:环境过滤驱动农田生态系统土壤古菌独特的空间分布(一作解读) 2019-03-10
主编按:大家还记得焦硕博士吧,2018年末在平台邀请下分享了其在《 Microbiome:土壤微生物驱动退耕还林系统土壤剖面的养分循环 》和《 SBB:石油污染土壤微 ...
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