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  • 中国科学院,遗传与发育生物学研究所,工程师

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dum8539 2018-6-16 14:29
刘老师,您好,我在安装mvpart包时,还是提示安装失败,无法使用,请问下安装过程中需要注意什么细节吗?盼复,谢谢老师。
hmzecology 2018-4-5 00:06
刘老师,请问Vsearch在windows系统如何安装运行?谢谢!
lizm526726 2017-12-19 23:02
老师,我有个问题想请教您,我现在在做一个项目,由90个样本,测的宏基因组,我想对宏基因组的数据的contigs聚类成binning,该如何操作呢? 我现在的做法是将每个样品的fastq map to contigs,得到覆盖深度,在根据覆盖深度进行聚类(concoct软件),得到的binning在用checkM软件进行评估。现在的问题是,我的项目是多个样本,而我现在得到的binning是每个样本的bining,所以后续我不知道该如何整合起来。 我看到14年的nature method的方法是将所有阳样品的fastq文件组装成一个contigs,但是他没有提供具体的方法。 老师您能给我一 ... ...
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水稻微生物组时间序列分析4-随机森林回归 2018-06-25
写在前面 之前分享了3月底发表的的 《水稻微生物组时间序列分析》 的文章,大家对其中图绘制过程比较感兴趣。一上午收到了超30条留言,累计收到41个小伙 ...
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水稻微生物组时间序列分析3-冲击图展示时间序序列变化 2018-06-20
写在前面 之前分享了3月底发表的的 《水稻微生物组时间序列分析》 的文章,大家对其中图绘制过程比较感兴趣。一上午收到了超30条留言,累计收到41个小伙 ...
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易生信-扩增子教程01-背景介绍 2018-06-20
距离上次《生信宝典》联合《宏基因组》组织的扩增子分析线下培训结束己经有三个多月了。为方便广大读者的学习,现在开始陆续分享上次培训的内部资料——理论课 ...
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R,Git和Github(下) 2018-06-18
作者:Wenhu 博客: http://bioinfostar.com/ 本讲第一部分,介绍git的“足够你用”命令;本讲为第二部分,介绍github的主要用途,包括版本管理、分枝管理 ...
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R,Git和Github(上) 2018-06-17
作者:Wenhu 博客: http://bioinfostar.com/ 本讲为第一部分,介绍git的“足够你用”命令;第二部分,还将介绍github的主要用途以及如何在R中使用git,部 ...
(272)次阅读|(0)个评论
水稻微生物组时间序列分析2b-散点图拟合 2018-06-17
写在前面 之前分享了3月底发表的的 《水稻微生物组时间序列分析》 的文章,大家对其中图绘制过程比较感兴趣。一上午收到了超30条留言,累计收到41个小伙 ...
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[转载]碳水化合物限制饮食对人类肝脂肪变性的快速代谢益处的综合理解 2018-06-16
本文转自“微生太”,已获授权,有修改。 导读 碳水化合物限制饮食是干预非酒精性脂肪肝疾病(NAFLD)的广泛推荐措施,但对这种饮食的多种益处的系统性观点还很 ...
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MiBioGen联盟倡议:综合分析人类基因组与菌群关系研究 2018-06-15
Meta-analysis of human genome-microbiome association studies: the MiBioGen consortium initiative DOI: 10.1186/s40168-018-0479-3 Microbiome于本月 ...
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