留言板
- [5]张志英
- 刘老师您好 我想看看您写的关于微生物互作网络图conet制作 那个博文 但是好像被屏蔽了 我想看看
- [4]陶雪
- 刘老师您好，请问一下，origin做柱状图组间连线怎么做的？谢谢。
- [3]杜彩丽
- 刘老师，您好，我在安装mvpart包时，还是提示安装失败，无法使用，请问下安装过程中需要注意什么细节吗？盼复，谢谢老师。
- [2]何明珠
- 刘老师，请问Vsearch在windows系统如何安装运行？谢谢！
- 我的回复(2018-5-18 09:17)：看软件主页，下载就可用。有详细的说明。
- 我的回复(2018-5-18 09:17)：看软件主页，下载就可用。有详细的说明。
- 我的回复(2018-4-20 17:37)：安装exe程序，添加环境变量即可。
- [1]李志明
- 老师，我有个问题想请教您，我现在在做一个项目，由90个样本，测的宏基因组，我想对宏基因组的数据的contigs聚类成binning，该如何操作呢？
我现在的做法是将每个样品的fastq map to contigs，得到覆盖深度，在根据覆盖深度进行聚类（concoct软件），得到的binning在用checkM软件进行评估。现在的问题是，我的项目是多个样本，而我现在得到的binning是每个样本的bining，所以后续我不知道该如何整合起来。
我看到14年的nature method的方法是将所有阳样品的fastq文件组装成一个contigs，但是他没有提供具体的方法。
老师您能给我一些建议吗？
