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零基础也可以做RNA-seq差异分析
陈莉娜 2017-3-3 12:33
基因表达谱的 差异分析 是RNA-seq中最常见的应用。你眼中的RNA-seq差异分析或许是酱紫的,对不会编程,不懂统计,纯正生物学出生的人, 内心简直SOS …… 但有些人眼中的RNA-seq差异分析却是这样的,借助云平台和图形化界面,生信零基础同样可以做RNA-seq差异分析。 本人也是第一次尝试,一起来看看云平 ...
个人分类: 生信分析|17258 次阅读|没有评论
如何在现有数据上,再发1+篇文章
陈莉娜 2016-11-30 09:43
在之前我们分别介绍了研究mRNA,miRNA,lncRNA的实验思路,在各自成文后,还能否进行联合分析从中挖掘更多有意思的东西呢? 这就是今天要介绍的ceRNA网络分析。 ceRNA ceRNA(competing endogenous RNAs) , 竞争性內源RNA,其 不是新的RNA,而 是从功能上定义的一类RNA的总称。 ceRNA具有miRNA结合位 ...
个人分类: 生信分析|7849 次阅读|没有评论
一文掌握GO和pathway分析
陈莉娜 2016-9-27 11:07
在做转录组分析的时候,如何从众多差异基因中筛选出目标基因呢 ? 下面就以一篇文章为例,来看看用什么方法可以缩小差异基因范围,使目标基因挑选更有针对性。 文章案例 Identification of a novel biomarker, SEMA5A, for non-small celllung carcinoma in nonsmoking women 相关基因: SEMA5A ...
个人分类: 生信分析|52755 次阅读|没有评论

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