赖江山的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/laijiangshan 生态、统计与R语言


  • 中国科学院,植物研究所,副研究员

    • 生命科学->生态学->群落生态学

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harpoonx 2021-5-6 16:29
赖老师,您好!     最近在学习《数量生态学(第二版)》中第四章4.11指示物种的内容,以下代码内容有疑问,向您请教。 “#聚类簇的分割和编号 dfsD1.kmeans$cluster #这个组号具有随机性,为了避免混淆,我们构建一个连续的编号给找个分组向量 grps <- rep(1:4, c(8,10,6,5))"     首先,环境数据集env有30个变量,计算后分为四组,提取dfsD1.kmeans中cluster数据可以看到四个组别中具体包含哪些变量,其中按照顺序第一组包含9个变量,第二组包含10个变量,第三组包含6个变量,第四组包含5个 ... ...
Bluce 2021-4-15 20:08
赖老师您好 ,我现在做生物因子和非生物因子对生物量的一个影响值的重要性排序,用到了R里的随机森林模型,但做出来的R2很小,要是筛掉几个因子,R2会是0.1左右,不筛选,全部放进去的话,R2还可能出现负值,我想保留全部因子,用随机森林结果中出现的IncNodePurity值,给因子做一个排序,不管R2,您看可以吗
jeanes 2021-4-10 20:45
赖老师您好!请问RDA分析中anova(sp.rda1, by = "term") 与envfit(sp.rda1, env, permu=999) 两者能否解释环境变量对物种组成的影响度?
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rdacca.hp用于在多元回归和典范分析中变差分解和层次分割的R包(preprint) 2021-03-12
rdacca.hp用于在多元回归和典范分析中变差分解和层次分割的R包(preprint)   摘要: 探索多响应变量与多解释变量之间关系的典范分析(canonical an ...
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国际植被科学协会“2019年洪堡奖章”授予Pierre Legendre颁奖词(Peter Minchin 致) 2021-02-25
国际植被科学协会“2019年亚历山大·冯·洪堡奖章”授予Pierre Legendre颁奖词( Peter Minchin 致) (来自 http://iavs.org/Awards/Legendre-AvH-Laudati ...
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为什么没有截距的线性回归的R2会变大? 2021-02-19
刚有个同学问为什么没有截距的线性回归的R2会变大?原理很简单,普通回归的R2: 下面是没有截距的R2,没有intercept的等于强制响应变量平均值等于0,自然R2 ...
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