科学网

 找回密码
  注册
搜索
热搜: 科学 论文
搜索
ASreml -r 及R语言 内存设置方法
邓飞 2017-6-19 15:02
​ workspace设置 8e6 = 64Mb 8e7 = 640Mb ​ 具体设置 设置 | 实际 —-|—- 8e6 | 64 Mb 1.28e8 | 1G 2.5e8 | 2Gb 5e8 | 4Gb 1e9 | 8 Gb 1.5e9 | 12Gb G矩阵占用内存的计算方法: 个体ID 标记数 8 /(1024*1024) = Mb 示例代码: asreml中设置运行内存为8G, ...
个人分类: 农学统计|5184 次阅读|没有评论
田间鉴定试验设计三部曲
邓飞 2017-5-23 10:44
本次介绍田间试验设计中常用的试验设计方法以及实现途径,试验类型分为初级试验、中级试验和高级试验。 试验设计方法: 初级试验 假设一家育种单位,选育玉米品种,前期配了5000个组合,由于种子量比较少,只能种植两行区一次重复。 可选试验方案:间比法、增广试验设计(augmented design)、P-rep设计 中级试验 ...
个人分类: 农学统计|2040 次阅读|没有评论
不平衡数据的显著性检验方法以及多重比较(How to)
热度 1 邓飞 2017-4-17 12:10
本节主要论述当数据存在缺失值或者不平衡数据时,如果进行显著性检验,进行多重比较,以及估算效应值。 主要用到的方法有ANOVA,unbalance ANOVA, Mixed model 数据下载 missing data.csv 本数据是二因素随机区组,N和S为两个因素,N有3个水平,S有4个水平,有3个区组。 数据缺 ...
个人分类: 农学统计|3932 次阅读|1 个评论 热度 1
如何对增广试验数据进行分析
邓飞 2017-4-11 10:28
参考文献下载 参考文献下载 莫惠栋. 植物育种中的试验设计:行列增广设计 . 扬州大学学报(农业与生命科学版), 1991, 11(1):71-80. 数据: augmented design data 测试品种:1~17 对照:A~E 表中上面是编号,下面是产量 结果 经过繁琐的计算后,得到三个结果,方差分析、矫正值和LSD 方差分析 矫正 ...
个人分类: 农学统计|2942 次阅读|没有评论
增广试验相对于间比法的优势
邓飞 2017-4-8 19:38
增广试验: 试验没有重复,测试品种无重复,对照有重复,一个区组包括一部分品种的试验,参试品种和对照随机排列。 间比法: 早期测试品种种,每隔10个或20个加1个或2个对照的试验设计。 增广试验相对于间比法的优势: 1,增广设计是随机的,对照也是随机的,因此不存在系统误差 2,增广设计可以给出品种的显 ...
个人分类: 农学统计|1895 次阅读|没有评论
关于遗传参数评估的培训通知
邓飞 2017-4-5 09:24
asreml介绍 ASReml是拟合线性混合模型的优秀数据分析软件,由NSW Department of Primary Industries的Arthur Gilmour博士开发,可利用灵活的混合线性模型和广义线性模型来处理大规模的数据,实现大数据高效、快速的分析。ASReml可对数量性状、阈值性状、分类性状、SNP标记等多个性状进行分析,并可实现固定效应、随机效应值 ...
个人分类: 农学统计|1413 次阅读|没有评论
欧洲土壤学报:重复测量数据的分析服务案例
邓飞 2017-3-24 08:49
欧洲土壤学报是土壤领域中比较知名的杂志,同时这个杂志也以统计方法审核严格著称。 案例 近期,我们帮客户提供了一个土壤方便的数据分析服务,主要分析的数据类型是重复测量数据,即不同处理时期(time)的观测值数据,分为对照和处理两个水平。 客户最初的分析方法 1,方差分析 2,裂区试验 编辑的意见 1,数据 ...
个人分类: 农学统计|2138 次阅读|没有评论
用Jupyter学习R语言的第一步:安装
邓飞 2017-3-11 18:00
R语言简介 R语言是一门统计语言,开源免费,让收费软件节节败退。 RStudio简介 因为R语言的操作界面不怎么友好,RStudio在R中流行起来,它可以将代码、结果、历史、图表一起展示。不用不知道,一用忘不了。它还有rmarkdown,Shiny 有人甚至是先知道RStudio的。。。 Jupyter简介 它以前叫Python notebook, ...
个人分类: 农学统计|9531 次阅读|没有评论

本页有 2 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2021-1-23 09:14

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部