科学网—niuneat的博文

置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读

2021-4-1 17:29

微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...

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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享

2020-4-27 13:34

谷禾健康原创近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况成为首要问题。高通量测序技术 ...

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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？

隐藏 2019-11-18 14:37

原文如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？谷禾健康原创做过16s测序的小伙伴们都知道测完之后会拿到一份结果报告但这并不代表可以开始写文章了看似一大堆数据图表却不知如何下手这是很多人头疼的地方那么怎样给报告中的数据赋予灵魂让它真正成为对你有帮助的分析呢？今天我们来详细解 ...

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[转载]感染与疾病，感染的逐步进阶以及伴随的疾病发展

牛耀芳 2024-7-3 17:45

病原微生物和/或有害微生物成功入侵、繁殖并定居于宿主的体内或体内，从而导致健康障碍，称为感染。简单地说，它可以定义为由微生物引起的疾病。感染也被称为传染病或传染病或传染性疾病。感染每年导致 1300多万人死亡；2019 年死亡人数为 1370万人（新英格兰医学，2022年统计）。在 ...

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[转载]儿童神经发育异常的脑肠轴视角 - 自闭症早期风险判别和干预新路径

牛耀芳 2024-6-30 21:35

自闭症谱系障碍 (ASD) 是一组神经发育疾病，其特征是社交互动和沟通的质量障碍、兴趣受限以及重复和刻板行为。环境因素在自闭症中发挥重要作用，多项研究以及谷禾队列研究文章表明肠道微生物对于自闭症的发生和发展以及存在明显的菌群和代谢物的生物标志物。 doi: 10.1136/ ...

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[转载]从菌群代谢到健康影响——认识丙酸盐和丁酸盐的利与弊

牛耀芳 2024-6-30 20:58

短链脂肪酸这一词经常出现在谷禾的文章和报告中，那你真的了解短链脂肪酸吗？短链脂肪酸(SCFA)主要是肠道微生物群在结肠内通过发酵碳水化合物 (包括膳食和内源性碳水化合物，主要是抗性淀粉和膳食纤维)和一些微生物可利用的蛋白质而产生的。短链脂肪酸主要是乙酸、丙酸和丁酸，在结肠中的浓度比大致为 6 ...

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[转载]植物木脂素的肠道微生物代谢：对人类健康的影响

牛耀芳 2024-6-26 15:43

植物多酚是一大类生物活性化合物，其特点是化学和结构特性不同、生物利用度低，并具有多种体外生物活性。在这些化合物中，木脂素因其类固醇类似物的化学结构而受到广泛研究，被认为是植物雌激素。木脂素是一类与纤维相关的化合物，存在于许多植物家族和常见食物中，包括谷物、坚果、种子、蔬 ...

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[转载]微生物测序报告中的多样性数据详细解读

牛耀芳 2024-6-26 15:32

随着技术的发展，高通量测序技术已成为研究微生物群落的重要工具。这种技术使得科学家们能够解析巨量微生物DNA序列，从而获得丰富的微生物组数据，包括 16S rRNA基因、 ITS序列和宏基因组。然而，这些数据只是迈向揭示微生物群落复杂性的第一步。通过对环境样本的可变区域如16S、18S、ITS序列进 ...

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[转载]找到你的专属健康食谱：结合肠道菌群与疾病状态

牛耀芳 2024-6-3 18:34

俗话说：“病从口入”。饮食是决定个人健康状况的重要因素，饮食与疾病的发展有关，特别是胃肠道(GI)疾病。与膳食相关的症状发生率很高，例如在吸收不良(如乳糖不耐症 )情况下出现的腹痛和腹泻；乳糜泻、食物过敏人群在食用麸质类后出现的腹胀、腹痛、水肿；肠易激综合征患者在摄入一些刺 ...

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[转载]机会性病原菌：爱格氏菌属（Eggerthella）和解黄酮菌属（Flavonifractor）的简介

牛耀芳 2024-5-27 16:50

爱格氏菌属（ Eggerthella ）爱格氏菌属（ Eggerthella ），厌氧、不产生孢子、不活动的革兰氏阳性杆菌，是人类肠道微生物组的常见成员，人群检出率比较高，属于放线菌门。大多数时候，Eggerthella 与多种疾病相关 Eggerthella 存在于人类结肠和粪便中，并被认为是溃疡性结肠炎、肝和肛门 ...

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[转载]免疫防御和代谢控制十字路口的炎性小体

牛耀芳 2024-5-20 20:39

人体的肠道粘膜内层形成物理屏障和免疫防御系统，以防止微生物入侵。当身体受到感染或细胞遭受损伤时，免疫系统会启动炎症反应来应对这些情况。炎症是对感染和组织损伤的一种急性反应，以限制对身体的伤害，这种反应是身体自然的防御机制，旨在清除病原体并修复受损细胞或组织。先天免疫 ...

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[转载]什么是阴道菌群CST分型，不同的分型代表哪些女性健康问题

牛耀芳 2024-5-15 16:56

人体内的各个部位，如皮肤、口腔、肠道和阴道等，都是微生物的重要栖息地，这些微生物与人体健康紧密相关，并能反映人体的疾病状态。这些部位因受基因、环境和生活方式等影响，具有独特的菌群特征。女性生殖系统包括卵巢、输卵管、子宫和阴道等主要器官，阴道微生态对女性生理健康、生 ...

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[转载]肠道病原体感染定植的三个关键角色——炎症、营养与共生菌群

牛耀芳 2024-5-6 14:30

日常生活中大部分人都可能碰到过食用了不卫生或过期变质食物以及水源后，出现过恶心、腹痛，并伴有腹泻、食欲不振、呕吐等症状？如果有就要当心，这可能是病原体感染引起的胃肠道炎症。但是，即使食用了同样食物水源，不同人表现不一样。有的人表现无严重症状，有的人却症状严重，那么是什么因素 ...

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