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置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
2021-4-1 17:29
微生物多样性测序(扩增子测序)是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测,获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题,在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
2020-4-27 13:34
谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体,而大量复杂的微生物群体存在培养困难,构成复杂(包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物)。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成,基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看?
隐藏 2019-11-18 14:37
原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果? 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢? 今天我们来详细解 ...
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如何使小鼠肠道微生物更接近人的肠道微生物
牛耀芳 2020-3-27 15:15
近日,美国加州理工的一项研究表明,当防止啮齿​​动物食用粪便时,它们的小肠微生物群与人类肠道中的微生物群落更为相似。 越来越多的人研究表明肠道微生物群参与人身心健康的许多方面,因为大多数营养和药物都是在这个位置被身体吸收的。为了研究肠道微生物群,研究人员通常使用小鼠和大鼠,因为这 ...
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[转载]「哮喘」-更精细和全面的认识
牛耀芳 2020-3-18 11:27
原创:谷禾健康 哮喘是一种常见的慢性呼吸道疾病,影响着全世界3亿多人。预计到 2025 年将增加到 4 亿人。 咳嗽、胸闷、喘息、气促等 发作起来的窒息感让人崩溃 喘息是如何发生的? 当一个人没有哮喘症状时,呼吸是顺畅的,空气可以很容易进出肺部,一旦哮喘发作,肺部就发生了变化: 气道外 平滑肌收紧 , ...
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[转载]怀孕期间母体肠道微生物分子保护后代免受代谢性疾病的影响
牛耀芳 2020-3-12 12:04
近日,日本学者发表在Science上的一项研究(DOI:10.1126/science.aaw8429)为妊娠期母体肠道微生物对后代健康影响新增一项证据,该研究表明表明,孕期母体肠道环境是影响后代代谢发育以预防代谢综合征的关键因素,因此,孕鼠肠道微生物群提供了一个环境线索,可以微调后代的能量稳态以预防代谢综合征的发育起源 ...
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[转载]欧洲拟南芥群落根系微生物群的组装与适应性分化
牛耀芳 2020-1-13 15:38
谷禾健康 原创 拟南芥(Arabidopsis thaliana),又名阿拉伯芥、鼠耳芥、阿拉伯草,是一种原生于欧亚大陆的小型开花植物,为一种模式生物,被广泛地应用于植物遗传学、细胞生物学、分子生物学,以及群体进化学等方面的研究中。据不完全统计,截止到2019年,已经有超过6万篇标题中含有拟南芥的学术论文发表,覆盖了几百 ...
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[转载]探索微生物前沿| 拟杆菌预防肺炎克雷伯菌定殖和传播
牛耀芳 2020-1-10 19:55
谷禾健康 原创 微生物群是免疫防御的原动力,但是防止感染的特定共生微生物的特性尚不清楚。相对的,病原体如何与其他微生物群落竞争以建立其宿主生态位也鲜为人知。 鉴定对病原体有保护作用的微生物群成员可以提供一种治疗对当前抗菌治疗有耐药性的感染的替代方法。 在这些抗药性微生物中,肠杆菌科是最大的临床问题 ...
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[转载]富含梭菌的微生物群促进腹泻型肠易激综合征胆汁酸排泄
牛耀芳 2019-12-24 15:46
谷禾健康 原创 腹泻症状是大多数患者通过稀便(从可流动到水样),尽管也存在异常频繁的排便(每天2次排便)。腹泻代表肠功能的改变,由于多种原因,肠道对水的净吸收减少,导致粪便含水量高。肠易激综合征(irritable bowel syndrome,IBS)是一组持续或间歇发作,以腹痛、腹胀、排便习惯和( ...
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[转载]细菌和病毒从母亲到婴儿的不一致传播
牛耀芳 2019-12-13 15:49
在婴儿出生的最初几天,婴儿肠道微生物群的一部分可以追溯到多种母体来源,包括阴道、皮肤、口腔和肠道微生物群。然而,在这些来源中,在母亲肠道中发现的细菌定植是长期坚持的主要驱动力。 事实上, 通过垂直传播的细菌(如双歧杆菌、瘤胃球菌、粪球菌)在婴儿肠道中进行接种会导致转录活性定植。 婴儿肠 道 ...
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[转载]肠道尿路病原体丰富度是细菌尿和尿路感染发生的危险因素
牛耀芳 2019-12-10 10:09
尿路感染又称为泌尿系统感染, 是尿路上皮对细菌侵入导致的炎症反应,通常伴随有菌尿和脓尿。尿路感染波及面广、诱因复杂以及人体各器官互为影响,让尿路感染形成反复发作、反复治疗,反复用药,最后导致菌群失调,霉菌感染,致使病情更加复杂。 近日,美国纽约威尔康奈尔医学院的一项关于大样本人群尿路感染 ...
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类似人肠道菌群的蜜蜂肠道菌群对植物多糖消化的分工
牛耀芳 2019-12-3 13:36
近日,中国农业大学食品科学与营养工程学院与德克萨斯大学奥斯汀分校综合生物学系联合研究的一项非常有意思的成果:“ Division of labor in honey bee gut microbiota for plant polysaccharide digestion (蜜蜂肠道微生物群对植物多糖消化的分工)”在线发表在LatestArticles|PNAS 期刊上,此研究揭 ...
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[转载]最新研究速递 | 柳叶刀:肠道微生物群在神经系统疾病中的作用
牛耀芳 2019-11-27 10:58
刚刚,来自爱尔兰 APC 微生物组研究所(APC Microbiome Ireland,简称APC)的APC John F Cryan,教授和 Timothy G Dinan教授在 Lancet Neurol《柳叶刀神经病学》上在线发表了综合评论文章: The gut microbiome in neurological disorders (肠道微生物群在神经系统疾病中的作用)。 在过去10年中,对肠道微生物群 ...
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