GitHub双重身份验证（two-factor authentication, 2FA）解决方案

黄健 2024-1-27 12:54

双十二的时候，收到 GitHub 官方的通知邮件，要求我启用 双重身份验证（ two-factor authentication, 2FA ） 用户。邮件主要内容如下： We're reaching out to let you know that, as announced last year, we have officially begun requiring users who contribute code on GitHub.com to have two-factor auth ...

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噬菌体展示技术诞生的启示：循序渐进，水到渠成

热度 1 黄健 2024-1-10 09:03

噬菌体展示 (Phage Display) 技术之父 乔治 · 史密斯 (George P Smith) 教授第一次接触噬菌体是在哈弗福德学院（ Haverford College ）读大学期间。他想挑战抗体产生的模板学说，证明抗体的抗原特异性决定于编码抗体的 mRNA 。于是他用噬菌体 T4 免疫兔子，然后从兔子脾脏提取 RNA ，加入无细胞 ...

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PGPLOT窗口美化

黄健 2023-9-22 11:14

对目前默认的PGPLOT窗口不太满意 ，耿耿于怀。最近看了 这样一个网页 ，有一些相关介绍。于是参考着在自己的主目录内新建了一个.Xresources文件，内容如下： # Created by Jian Huang to customize PGPLOT windows # To hide the PGPLOT server window set pgxwin.server.visible: False # To provide a way to destr ...

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AlphaMissense不完全测评报告

黄健 2023-9-22 09:22

这两天我的微信群与朋友圈颇有被Google DeepMind团队刚刚在 Science杂志上发表的AlphaMissense 刷屏的趋势，说能精准预测蛋白质错义突变的表型。根据介绍，这个 AlphaMissense既对AlphaFold进行了微调，考虑了蛋白质结构的影响，又整合了一种受 ChatGPT 等大型语言模型启发的神经网络，有蛋白质语言模型的加持。AlphaFo ...

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比较giza-dev与pgplot5

黄健 2023-8-31 17:05

虽然解决了 PDL::Graphics::PGPLOT不能完全正常工作的问题 ，但对giza还是有点留恋的。因为giza只显示画图的窗口，且窗体默认背景是我比较喜欢的白色，而且其中产生的图与图中标记的文字也更漂亮。当然，我不大喜欢giza窗口默认的标题giza，也很无奈放大窗口图就消失。此外， giza窗口无 法通过点击窗口的x钮关闭，但通 ...

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解决PDL::Graphics::PGPLOT不能正常工作的问题

黄健 2023-8-31 15:28

如前所述 ，最近在把两个版本的PDL Book（2012年2月版、2015年5月版）的电子书（.pdf格式）转化为可在IPerl内核的Jupyter Notebook中进行交互学习的电子书（.ipynb格式）。在制作基于2012年2月版第二章内容的.ipynb文件时，示例中的use PDL::Graphics::TriD代码居然不工作， 最终自己想办法找到问题解决了 。 ...

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解决PDL::Graphics::TriD不工作的问题

黄健 2023-8-18 16:32

最近在把两个版本的PDL Book（2012年2月版、2015年5月版）的电子书（.pdf格式）转化为可在IPerl内核的Jupyter Notebook中进行交互学习的电子书（.ipynb格式）。在制作基于2012年2月版第二章内容的.ipynb文件时，示例中的use PDL::Graphics::TriD代码居然不工作，并反馈错误信息： Can't load '/usr/ ...

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升级到Ubuntu23.04

黄健 2023-7-6 19:07

系统给我推送了好多次，可以升级到23.04版了，可之前 升级导致的种种问题 经历 让 我不敢造次。前段时间 折腾MXNet与AI-MXNet中出了各种状况 ，刚刚我已说过一些。其实还有很多没说，比如我尝试过各个版本的MXNet；对于AI-MXNet，除了手动源代码编译安装外，也尝试过sudo cpan，或用户cpanm安装。 值得特别一书的是 ...

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在Ubuntu上从源代码安装MXNet及Perl编程接口

黄健 2023-7-6 15:00

近年来，深度学习非常火，也发展出TensorFlow、Keras、Caffe、PyTorch、Theano、CNTK、 MXNet 、PaddlePaddle、Deeplearning4j、ONNX等一系列开源的深度学习框架。在深度学习相关应用开发中，使用最为广泛的无疑是Python编程语言。就我所知，目前，只有MXNet提供了Perl编程语言的API。六年前，我 在基于Gentoo Linux的服 ...

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