TickingClock的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/TickingClock

博文

Nat Commun:拟南芥中FCA同源基因SSF的分子变异作用于开花时间调控(补2020-12-05)

已有 2146 次阅读 2020-12-4 09:50 |个人分类:每日摘要|系统分类:论文交流

Molecular variation in a functionally divergent homolog of FCA regulates flowering time in Arabidopsis thaliana

第一作者Yunhe Wang

第一单位安徽农业大学

通讯作者Peijin Li


 Abstract 


研究背景The identification and functional characterization of natural variants in plants are essential for understanding phenotypic adaptation.


主要发现:Here we identify a molecular variation in At2g47310 that contributes to the natural variation in flowering time in Arabidopsis thaliana accessions.


结果1-FCA拮抗基因SSF:This gene, which we term SISTER of FCA (SSF), functions in an antagonistic manner to its close homolog FCA.


结果2-SSF与FLC表达:Genome-wide association analysis screens two major haplotypes of SSF associated with the natural variation in FLC expression, and a single polymorphism, SSF-N414D, is identified as a main contributor.


结果3-SSF与CUL1互作:The SSF414N protein variant interacts more strongly with CUL1, a component of the E3 ubiquitination complex, than the SSF414D form, mediating differences in SSF protein degradation and FLC expression.


结果4-FAC与SSF起源FCA and SSF appear to have arisen through gene duplication after dicot-monocot divergence, with the SSF-N414D polymorphism emerging relatively recently within A. thaliana


结论:This work provides a good example for deciphering the functional importance of natural polymorphisms in different organisms.


 摘  要 


植物中天然变异的鉴定和功能分析对于我们深入理解植物的表型适应性是至关重要的。本文中,作者在拟南芥中鉴定到了一个At2g47310基因,其分子变异作用于不同拟南芥材料开花时间的天然变异。作者将其重新命名为SISTER of FCA,缩写SSF,以拮抗的方式作用于它的同源基因FCA。全基因组关联分析显示两个主要的SSF单倍型与FLC基因表达的天然变异相关,并且作者进一步鉴定到了主要影响位点,即一个多态性位点SSF-N414D。相比于SSF414D,SSF414N变体与E3泛素化复合物组成蛋白CUL1的互作更加紧密,导致了SSF蛋白的降解水平表现出差异,进而影响FLC基因的表达。FCA和SSF可能是在真双子叶和单子叶植物分化之后通过基因复制的方式形成的两个拷贝,而SSF-N414D这个多态性位点是拟南芥中新形成的。本文的工作为破译不同生物中自然多态性的功能重要性提供了一个很好的范例。


 通讯作者 

**李培金**


个人简介:

1996年,安徽大学,学士;

1999年,安徽农业大学,硕士;

2007年,中科院遗传与发育生物学研究所,博士;

2007-2015年,英国John Innes Centre,博后;

2015年-至今,安徽农业大学,特聘教授。


研究方向:

1. 植物花期调控的分子网络解析; 

2. 玉米抗逆关键基因挖掘和分子育种; 

3. 植物抗虫作用机制解析和应用。


doi: 10.1038/s41467-020-19666-0


Journal: Nature Communications

Published date: Nov 17, 2020



https://blog.sciencenet.cn/blog-3158122-1261072.html

上一篇:Plant Biotechnol J:地上地下结实性植物二型豆基因组
下一篇:Nature:大麦泛基因组研究
收藏 IP: 121.248.138.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-26 12:36

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部