进化生态学与生物地理分享 http://blog.sciencenet.cn/u/zjlcas

个人简介
研究兴趣:  生物地理学、群体遗传学与系统发育比较分析

主页: http://jinlongzhang.weebly.com

Email: jinlongzhang01@gmail.com

单位:瑞典Umea大学 生态与环境科学系
统计信息

已有 119379 人来访过

将比对好的fasta序列转换成relaxed phylip格式 2012-01-18
将比对好的fasta序列转换成relaxed phylip格式 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com 有时,在推断进化树的过程中,我们希望phylip格式的文件能够将序列的名称完 ...
(91)次阅读|(0)个评论
什么是bootstrap? 2011-12-30
Bootstrap又称自展法,是用小样本估计总体值的一种非参数方法,在进化和生态学研究中应用十分广泛。例如进化树分化节点的自展支持率等。 Bootstrap的思想,是生 ...
(232)次阅读|(3)个评论
一个简单的马尔可夫链 2011-12-01
一个简单的马尔可夫链 在一个随机过程中,如果事件发生概率在t时刻所处的状态为已知时,它在t + 1时刻只与t时刻的状态有关,而与之前所处的状态无关,则称该过 ...
(670)次阅读|(5)个评论
二项分布的对数似然面:算法与R语言实现 2011-11-19
二项分布的对数似然面 : 算法与 R 语言实现   jinlongzhang01@gmail.com   对数似然面是极大似然估计的结果之一 ...
(386)次阅读|(0)个评论
用R语言绘制似然面Likelihood Surface 2011-11-18
本文的目的,是直观表达极大似然估计。给出一组数,若用正态分布拟合,则其平均值和标准差最可能的取值是什么? 极大似然面的顶点,就是最优估计。实际情况下, ...
(402)次阅读|(0)个评论
6亿年来的海陆变迁 2011-11-05
晚元古代(600MA)6亿年前 元古代末期(560Ma) 5.6亿年前 早寒武纪(540Ma) 5.4亿年前 晚寒武纪(500MA) 5.0亿年前 中奥陶纪(470Ma) ...
(352)次阅读|(0)个评论
如何编写R函数 2011-10-26
如何编写R函数? 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com    R语言实际上是函数的集合,用户可以使用base,stats等包中的基本函数,也可以自己编写函数完成 ...
(742)次阅读|(2)个评论
Inno setup 制作安装文件以编译FigTree为例 2011-10-17
Inno setup 制作安装文件以编译FigTree为例 张金龙 (jinlongzhang01@gmail.com) Windows下安装文件的制作为软件的安装和卸载提供了方便。用户不再用担心可 ...
(412)次阅读|(0)个评论
Cygwin 简明指南-以编译r8s为例 2011-09-23
Cygwin 简明指南 - 以编译源代码   张金龙 Jinlongzhang01@gmail.com   Cygwin 是 Windows 平台下的一套 Unix/ ...
(555)次阅读|(0)个评论
如何撰写生态学科研论文? 2011-08-07
如何撰写生态学科研论文?  张金龙     科研论文是科学家贡献的最直接标志。好的研究论文往往具有很强的生命力,在十几年, ...
(774)次阅读|(2)个评论
PCNM:生态学与空间统计学 2011-07-28
PCNM 动画展示 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com PCNM是Legendre教授等开发出的表示空间关系的方法,类似于pcoa。大量应用在生物多 ...
(881)次阅读|(1)个评论
Tortoise SVN管理本地代码 2011-05-30
Tortoise SVN管理本地代码 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com 什么是Tortoise SVN? TortoiseSVN是一个windows下的文档版本管理的开源软件。用户每次对自己编写的 ...
(932)次阅读|(1)个评论
报告《R与进化生态学:系统发育比较分析概述》 2011-05-28
       随着测序和进化树推断理论和技术的不断成熟,生态学家正努力将物种系统发育关系整合到生态学研究中,并逐渐发展出一系列研 ...
(804)次阅读|(4)个评论
R语言检验空间自相关Moran's I和运行SAR模型 2011-05-25
如何用spdep程序包检验空间自相关Moran's I? 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com 在空间取样中位置越接近的点相应的变量也可能越相近,这种 ...
(995)次阅读|(2)个评论
ltt.plot从进化树推断物种分化的历史:分类单元数与时间的关系 2011-05-18
Lineages through time plot 从进化树推断物种分化的历史: --分类单元数与时间的关系   NM Hallinan原著, Nick Matzke增补 张金龙 编译绘图 ...
(671)次阅读|(4)个评论

查看更多

Archiver|科学网 ( 京ICP备07017567 )

GMT+8, 2012-2-12 16:04

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007-2012 中国科学报社