关于Cox回归模型你需要知道的数学

邵斌 2015-3-22 21:25

生物统计技术：Kaplan-Meier生存曲线与COX回归模型 返回文章列表 Kaplan-Meier生存曲线 Kaplan-Meier生存曲线适用于对某人群进行跟踪，直至出现一个特殊事件或终点，如死亡、癌症复发等。对所有研究对象从某特定时间点开始追踪，记录出现特殊事件的时间。通常当所有研究对象出现该事件时研究才结束，但由于 ...

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生物中的逆向工程技术（六）：CellNet与细胞工程

邵斌 2015-2-10 23:01

之前的一些文章被我总结在这里 生物中的逆向工程技术（一）: 线性方程 生物中的逆向工程技术 （二）：参数模型 生物中的逆向工程技术 （三）：布尔网络模型 生物中的逆向工程技术 （四）：贝叶斯网络 生物中的逆向工程技术 （五）：利用相关系数得到直接相互作用 生物中的逆向工程技术 （六）：CellN ...

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生物中的逆向工程技术（五）：利用相关系数得到直接相互作用网络

邵斌 2015-1-17 12:40

大家在实际科研中经常碰到一个问题，就是在实验中根据转录组数据后可以求出一个共表达网络，知道哪些基因一起表达但不知道基因之间实际是怎样相互作用的。共表达其实是基于基因之间的相关系数，而相关系数跟实际的作用机制大概是一个包含的关系。即有调控关系相关系数比较大，相关系数比较大不一定有调控关 ...

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科学杂志评出的年度十大进展

邵斌 2014-12-27 23:42

这周在翻最近的Science的文章，发现上周出了一期介绍了2014年几个breakthrough，看了看发现都挺有意思的，有几个我比较关心，在这做一点介绍。 返老还童的老鼠 这是一个比较有趣的实验，研究者把年轻老鼠和年老老鼠的血液循环系统连接到了一起，发现老年老鼠的大脑和肌肉系统竟然变得更有活力。这种实验技术可 ...

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介绍几款网络作图软件

热度 1 邵斌 2014-9-5 21:23

笔者是做生物网络的，日常工作中少不了做些网络图，这里向大家介绍几款相关软件。 1. pajek ，比较小巧易用，功能和layout也算比较多。应该读作bayak，原意是蜘蛛的意思，一张典型的图如下所示 这是一张讲生物网络鲁棒性的图，比较经典，已经是一本system biology书的封面 2. cytoscape ...

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作为算法的中医

热度 3 邵斌 2014-5-26 22:55

我在这谈谈我的看法，欢迎大家批评，转载请注明。现代很多人从科学方法出发研究中医，包括控制实验，动物模型，数理建模等等，不太接近传统做法。通而言之，我对这些努力持比较悲观的态度。我个人理解，中医跟某些算法是相近的，从算法的角度理解中医，或许可以帮助我们了解哪些研究看起来是可能的，而哪些不是。我的看法 ...

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见过的最无语的审稿意见

热度 1 邵斌 2014-3-29 16:26

Comments to the Author 1. Is the manuscript technically sound, and do the data support the conclusions? The manuscript must describe a technically sound piece of scientific research with data that supports the conclusions. Experiments must have been conducted rigorously, with appropriate con ...

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