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转化生物信息学
崔雷 2015-9-21 11:11
转化生物信息学是一个新兴领域,其目标是开发新的计算技术以促进传统的转化研究,手段是汇聚分子生物信息学、生物统计学、统计遗传学、和临床信息学。转化生物信息学比以前更加有力,并成为生物学发现与临床信息学之间的紧密衔接点。计算技术通过把构成用药、疾病、基因组的多维数据与临床和病理特征集成到一起发挥作用, ...
个人分类: 生物信息学|5713 次阅读|没有评论
量化药物的化学之美(译文)
热度 1 崔雷 2015-4-13 14:02
Quantifying the chemical beauty of drugs. Bickerton GR , Paolini GV , Besnard J , Muresan S , Hopkins AL Nat Chem. 2012 Feb; 4(2):90-8 摘要:“与药物相似”( Drug-likeness ) 是药物发现早期选择化合物时的关键考量。但是,绝对意义上的药物相似性评价不能恰当地反映化合物 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|6094 次阅读|2 个评论 热度 1
我们管理的那个东西
崔雷 2015-3-26 08:34
没有数据的繁华, 没有知识的高冷。 是数据后面的灵魂, 是知识生长的阳光。 它 是 数据和知识之间游荡的一缕轻烟, 它叫信息。
个人分类: 休闲|3801 次阅读|没有评论
译文:网络重新布局是基因重要性改变的重要机制
崔雷 2015-1-28 13:40
Network rewiring is an important mechanism of gene essentiality change 网络重新布局是基因重要性改变的重要机制 基因重要性 改变对于生物进化十分重要。但是同源物种之间重要性如何变化却是不清楚的。我们根据网络演变的框架和基因组比较分析,研究酵母菌和小鼠 基因重要性 变化的 ...
个人分类: 生物信息学|3765 次阅读|没有评论
译文:一种针对代谢网络中的涌现特性的数学方法:局部耦合,超弧
崔雷 2015-1-28 11:18
A mathematical approach to emergent properties of metabolic networks:Partial coupling relations,hyperarcs and fl ux ratios 一种针对代谢网络中的涌现特性的数学方法:局部耦合,超弧和流量参数。 系统生物学中的涌现特性只有在达到一定的复杂程度的时候才能产生。本研究介绍 ...
个人分类: 生物信息学|3944 次阅读|没有评论
书目共现聚类分析的视频
热度 9 崔雷 2014-9-24 10:20
见笑了啊!一次医学继续教育的视频。 书目数据共现分析(1) 概述 书目数据共现分析(2) 下载 书目数据共现分析(3) 抽取 书目数据共现分析(4) 聚类 书目数据共现分析(5) 结果分析
个人分类: 文献计量学|12796 次阅读|16 个评论 热度 9
且读且议论(5):矩阵!矩阵!!矩阵!!!
热度 4 崔雷 2014-7-1 10:13
Loet Leydesdorff和Liwen Vaughan 于2006年发表于 Journal of the American Society for Information Science and Technology (JASIST)上的一篇文章,题目是Co-occurrence Matrices and their Applications in Information Science: Extending ACA to the Web Environment。 我觉得这是很多对共现分析感兴趣的人必须 ...
个人分类: 文献计量学|18031 次阅读|9 个评论 热度 4
文献计量学投稿中经常遇到的败笔
热度 5 崔雷 2014-6-11 11:37
已经写了几篇关于投稿审稿的博文了,今天憋不住再唠叨几句。 1. 结论和结果脱节。这是对学科热点前沿进行文献计量分析的论文中最近常看到的,也最让我无奈的问题。从道理上讲, 结论应当来自于对研究结果的分析,但是很多投稿的结论与数据处理后得到的结果风马牛不相干 , 不是对 多维标度、聚类分析和社会网络分 ...
个人分类: 科研体会|19333 次阅读|7 个评论 热度 5
书目共现分析实践培训班6月23日开班!
热度 2 崔雷 2014-6-5 12:49
【不好意思,这回收钱了】 国家级继续医学教育项目 开 课 通 知 题目: 文献共现分析方法在科研选题中的应用 时间: 201 4 年 6 月 2 3 日 -2 4 日 地点:沈阳市和平区北二马路 92 号,中国医科大学图书馆综合楼 7 楼 CAI 实验室 注: u 受上机和网络条件限制,仅 ...
个人分类: 文献计量学|6492 次阅读|5 个评论 热度 2
且读且议论(4):同被引分析登场
热度 2 崔雷 2014-6-4 09:48
【这是1973 年, Small H首次 提出了同被引概念的论文】 在研究科学论文之间关系的时候, 文献之间的引用一直以来都是众多研究者广泛使用的手段。在探索文献之间关系的道路上,引文耦合【bibliographic coupling,台湾译成书目对,感觉更加亲民一些】的提出要早于同被引,而同被引则一直不受重视。可能的原 ...
个人分类: 文献计量学|12044 次阅读|3 个评论 热度 2

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