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fasta格式转化-fasta_formatter
余慷 2014-8-28 23:08
fasta_formatter -h usage: fasta_formatter Part of FASTX Toolkit 0.0.13.2 by gordon@cshl.edu = This helpful help screen. = FASTA/Q input file. default is STDIN. = FASTA/Q output file. default is STDOUT. &nb ...
个人分类: Bioinformatics|3880 次阅读|没有评论
Primer3-PRIMER_ERROR=thermodynamic approach chosen..解决办法
热度 1 余慷 2014-3-6 11:13
安装Primer3后,发现直接使用命令 primer3_core example example.out 出现错误: “PRIMER_ERROR=thermodynamic approach chosen, but path to thermodynamic parameters not specified” 1. 一种解决办法是输入命令时加入-default_version=1的参数 primer3_core -default_version=1 -output=ex ...
个人分类: Bioinformatics|8953 次阅读|1 个评论 热度 1
根据bwa比对的SAM初步估计片段大小
余慷 2013-4-16 16:56
Linux命令即可,较快,但是不太严格
个人分类: Bioinformatics|4678 次阅读|没有评论

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