NIH VideoCasting and Podcasting

热度 1 李雷廷 2014-6-5 15:06

http://videocast.nih.gov/PastEvents.asp?c=0s=1

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SAMtools-0.1.19中seqtk工具不见了

李雷廷 2013-12-17 16:12

seqtk是Heng Li开发的一个处理序列的程序，非常方便快速。这个工具之前是整合在SAMtools源代码包中的，但是在2013年3月19日SAMtools更新到0.1.19版本后，这个工具被移除了，很奇怪。不过，这个seqtk工具是可以单独下载安装的。 git clone https://github.com/lh3/seqtk.git 下面是seqtk的用法 Usage:   ...

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Network Utility.app在OS X Marvericks中的位置

李雷廷 2013-12-17 15:51

苹果操作系统中的Network Utility是一个非常好用的工具，可以查询网卡地址，IP地址，可以可视化地运行ping，Whois，Traceroute，Port Scan等工具。 在10.9之前版本的OS X操作系统Snow Leopard, Lion, Mountain Lion中，这个工具的位置是/Applications/Utilities/Network Utility.app，可以在Launchpad中看到。但是到10 ...

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CentOS: 开放80、22、3306端口的方法

李雷廷 2013-12-16 22:12

开启端口的命令 iptables -I INPUT -p tcp --dport 80 -j ACCEPT iptables -I INPUT -p tcp --dport 22 -j ACCEPT iptables -I INPUT -p tcp --dport 3306 -j ACCEPT 查看端口开放的命令 service iptables status 关闭端口的命令 iptables -D INPUT 1 参考资料： http://blog.sina.com.cn/s/blog_3eba8 ...

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[转]康奈尔生物统计学家张志武2014年招收博士生三名

李雷廷 2013-12-6 16:18

张志武 2014 年招收博士生三名 【博士导师简介】 统计遗传学家，就任康奈尔大学遗传多样性研究所，兼东北农业大学外聘教授。 2007 年将遗传标记关系矩阵引入 MTDFREML 遗传评估系统，推动了全基因组选择实用算法： GenomicBest Linear Unbiased Prediction (gBLUP) ， 2010 年发明压缩式混合线性模 ...

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生物信息学问答论坛索引

李雷廷 2013-1-27 18:53

BioStar http://www.biostars.org/ 英文 SEQanswers http://seqanswers.com/ 英文 云生物 http://yunbio.com/ 中文 BioASK http://www.bioask.net/ 中文

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利用基因号从TAIR网站批量下载拟南芥基因序列的方法

李雷廷 2013-1-19 13:43

TAIR The Arabidopsis Information Resource http://www.arabidopsis.org/ 1 在TAIR主页，把鼠标放在工具栏“Tools”标签下，滑动鼠标至该标签弹出列表的“Bulk Data Retrieval”处，点击该标签，进入“Bulk Data Retrieval and Analysis”页面，网址： http://www.arabidopsis.org/tools/bulk/index.jsp 。 & ...

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论文阅读——生物信息学资源组学(Resourceome)

李雷廷 2012-6-28 08:56

【论文阅读笔记，Leiting, Jun 27, 2012】 A decade of web server updates at the bioinformatics links directory: 2003–2012 Nucl. Acids Res. (2012) 40 (W1): W3-W12. doi: 10.1093/nar/gks632 因为数量的大量增加，对于生物信息学的研究人员来说，跟踪生物信息学工具和数据库变得越来越困难，因此， ...

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生物信息学之期刊分析

热度 2 李雷廷 2012-6-22 10:46

【前言：有意梳理目前生物信息学的期刊状况，因此整理成文，Leiting, Jun 17, 2012】 生物信息学领域的学术期刊，目前有 5 份名字中带有 Bioinformatics（筛选自SCI期刊目录）。这 5 份期刊影响因子最高的是 Briefings in Bioinformatics，为9.283，但是年发文量太少，只有 14 篇，有虚高的嫌疑。生物信息学领域的主力 ...

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