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科学网博文索引：生物信息学

热度 2 2012-6-17 15:15

【前言：整理科学网上关于生物信息学的博文，把这一主题相关的博文链接贴在这里，方便阅读研究，并会不断搜集整理更新，Leiting, June 17, 2012】 1 综合篇 2012.09.19，牛登科， 生物信息学，可以安于非主流，而且应该庆幸非主流 2012.09.19，吕强， 生物信息学不需要裸奔 2012.09.18，薛宇， 上 ...

个人分类: 生物信息学|5344 次阅读|2 个评论 热度 2

科研撞车之两篇谷子(Setaria italica)全基因组测序论文同时发表

热度 2 2012-5-14 23:58

据新闻【1，2】报道，中国科学家完成了谷子(英文名：foxtail millet, 拉丁学名： Setaria italica )【3】全基因组测序，成果发表于《自然-生物技术》杂志。具体的内容详见新闻，令我感到诧异的是，在我查找 Nature Biotechnology 上的原文时，居然在“Advanced online publication”上出现了两篇谷子全基因组测序的论文【4 ...

个人分类: 论文阅读|14813 次阅读|3 个评论 热度 2

Perl代码实例之词频统计软件word_freq

热度 2 2012-4-26 13:55

今天在读《Shell 脚本学习指南》 时得到启发，很有兴趣写一个词频统计的软件。因此就花了几个小时用Perl语言写了一个100多行代码的软件。word_freq以自由软件 、开放源代码 的形式发布在此。文后附有源代码。 一、运行环境 1 perl 软件是由 Perl 写成，因此运行软件前，电脑上必须有 perl 解释器 , 可以在这 ...

个人分类: Perl代码|8627 次阅读|3 个评论 热度 2

Perl代码实例分析之从下载序列·一

热度 1 2012-4-26 13:25

从网 络 上下 载 DNA ， mRNA 或 protein 序列，是分子生物学和生物信息学的基本功。最 简单 的下 载 序列的方式莫 过 于直接从 NCBI ( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ) 检 索到序列，然后通 过 网 页 上的 Send to 选项下载之。本文的目的是通过对一例序列下载 Perl 语言代码来简要介 ...

个人分类: Perl代码|7051 次阅读|1 个评论 热度 1

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