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sair方法及R操作入门——稳定同位素之食物来源比例分析

已有 21903 次阅读 2016-10-5 20:29 |个人分类:同位素|系统分类:科研笔记| siar

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在稳定同位素领域,20世纪70 80 年代开始,利用碳氮稳定同位素来研究食物网结构成为有力的技术手段,以弥补传统的胃含物方法中较难分析的空胃率较高的生物的缺陷。

在食物网研究中,主要包括食物来源和营养级的分析。其中,食物来源分析中严格来讲,1种同位素只能对应2种食物来源的分析,n种同位素相对应n+1种食物来源的分析。

问题是,例如有5种食物来源,只用碳2种同位素进行食物来源分析就很困难,20世纪后半叶普遍采用的方法是Isosource软件进行计算。但是这种方法:①只使用饵料生物同位素的平均值,未考虑标准差的影响;②只使用固定浓缩系数(TEF)值(e.g., 碳氮同位素分别使用1‰ 和3.4‰),也未考虑其标准差的影响等(Parnell AC, Inger R, Bearhop S, et al.,2010)。


本文简要介绍基于贝叶斯算法的最新方法: siar(stable isotope analysis in R)在R软件上的操作过程。

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