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- [bio]WHU-iGEM-2013年纳新宣讲会幻灯片
- 幻灯片地址: http://puriney.github.com/herecomesmath/#/start 会围绕支原体全基因组数学模拟来扯淡, 本来希望吸收些数院的同学, 没想到全场都生科, 略显尴尬了些. 建议使用支持html5的浏览器, chrome/firefox/safari/opera(=10.5)/IE9来浏览.
- 【bio】颤抖吧！数学来了！支原体数学模型从基因型预测表型
- 从CELL封面2012年7月20日图来看： 左上密码子表（确定无误） 右上FBA （确定无误） 左中名词解释 （确定无误） 右中是状态机 左下随机过程马尔可夫过程（四种RNA聚合酶结合状态） 右下mRNA降解/生成动态平衡（以基因预测？）
- 【乱扯】单细胞水平研究确实靠谱！
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- 早些时候本人自己乱想了些问题（ 如何确定基因敲除是在对所有细胞都管用？还是只是概率事件？ ） 发现这些问题也确实有人也在想，并且确实发表了相关文章。 以2012年2月出现的一篇 在Molecular Cell上发表的《Single-Cell Analysis Reveals that Noncoding RNAs Contribute to Clonal Heterogeneity by Modulating ...
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【bio】交叉学科盛行时代生命科学研究者的立足点
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【引言】 武大生科教授研究生蛋白质组课的非常有个性的女教授Prof Guo一次不禁零碎的感叹，蛋白质组学越做到最后就越是computer dependent。 本人涉足蛋白质学生物信息分析的好机油小赫赫吐槽，关键在于实验、设备（质谱、色谱柱之类的草泥马太重要了），后续生物信息分析超无力，杯水车薪... 在交叉学 ...
- 感恩节特献，听妈妈的话，早睡早起身体好
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“早睡早起身体好”很显然是老生常谈，现代都市人很显然也知道黑白颠倒的生活让自己憔悴，但是武装着科学理性精神的亲们内心始终秉持着一个信念：“哼，玄妙的保健养生，民科！”不过很不巧，这回民科有理。 探究生物钟与水嫩肌肤之间潜在关系，再添科研重炮！生物钟紊乱将导致组织提前老化、催生皮肤癌发生 ...
- 如何确定基因敲除是在对所有细胞都管用？还是只是概率事件？
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【引子】 最近在思考本人课题（其实一直在思考），拨开课题特例本身，牵扯到一个小问题，而这个问题我个人感觉是有普遍性地（虽然对于一般的基因工程而言多余的）。基因下调，效果究竟是作用在一个细胞而言还是一群细胞而言的。 --- 简单而言，RNA splicing里有个有趣的设计， ...
- 神棍节特献--GEEK们能和自己喜欢的妹子正常对话么？
- 最近在看线代和算法方面的资料，必不可少地需要看诸多博客，比如matrix67。此刻我不禁想，这些个GEEK们能找到喜欢且 合适 的妹子么？！GEEK们的智商和思维和常人完全不在一个象限、一个维度里，而如今拜金女、懵懂妹甚多，拜金女们懂得GEEK们的才智却不稀罕、懵懂妹稀罕GEEK们却完全不懂GEEK们的才智，着实是替GEEK ...
- 【bio】“吸血鬼”细菌——“我是活着的战士”
- 今天一边目睹了google reader的恶心UI变化，同时也发现了一个挺好玩的研究—— “吸血鬼”细菌 【 1 】。当看见Pseudomonas aeruginosa（绿脓假单胞菌）时本人眼前一亮，而当antibotic、disease、lung infection等字眼同时出现时，我知道，这又是一项“舒肤佳杀菌、保护人类健康”的研究。所针对的敌人 ...
- 生物计算机
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一切源自于这篇paper，我表示我看过了abstract之后觉得这其实挺简单的。（对于这篇文章我个人的欣赏容我把原理和吐槽说完再写） 但是几天之后 生物谷等开始给于评论 说：英国研究人员最近用细菌和基因手段开发出一种可模块化的新型“生物逻辑门”， 为研制生物计算机铺平道路。 我不知道这是哪家 ...
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